More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0294 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0294  ABC-3 protein  100 
 
 		 306 aa  579  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0604  cation ABC transporter, permease protein, putative  64.04 
 
 		 296 aa  318  9e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0756  ABC-3 protein  64.04 
 
 		 301 aa  317  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.929566  normal  0.294702 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2367  ABC-3 protein  58.8 
 
 		 279 aa  199  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.943985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2615  ABC-3 protein  43.89 
 
 		 291 aa  182  8.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1167  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 293 aa  138  8.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1956  ABC-3 protein  36.95 
 
 		 264 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.775188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2616  ABC-3 protein  38.49 
 
 		 272 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0326  cation ABC transporter, permease protein, putative  39.22 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1027  metal ABC transport system permease protein  39.22 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0624  putative cation ABC transporter, permease protein  39.22 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2458  putative cation ABC transporter, permease protein  39.22 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0864  putative cation ABC transporter, permease protein  39.22 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0868  putative cation ABC transporter, permease protein  39.22 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0072  putative cation ABC transporter, permease protein  39.22 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2518  ABC-3 protein  39.22 
 
 		 262 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2650  ABC-3 protein  39.6 
 
 		 260 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5933  ABC heavy metal transporter, inner membrane subunit  38.8 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0688  cation ABC transporter, permease protein, putative  38.04 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1992  hypothetical protein  38.4 
 
 		 260 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2602  ABC-3 protein  38.4 
 
 		 260 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2626  ABC-3 protein  38.8 
 
 		 260 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0695  ABC-3 protein  37.85 
 
 		 260 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0295  ABC-3 protein  40 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3251  ABC-3 protein  38.43 
 
 		 260 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494903 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0715  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, inner membrane subunit  38.43 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1186  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.7 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4921  ABC-3 protein  33.46 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0485  ABC-3 protein  38.04 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.336382  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5102  ABC-3 protein  35.4 
 
 		 288 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593949  normal  0.159747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4717  hypothetical protein  35.04 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4803  ABC-3 protein  35.04 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1456  ABC-3 protein  33.08 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5318  ABC-3 protein  33.6 
 
 		 285 aa  99  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0605  cation ABC transporter, permease protein, putative  35.71 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.999911  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2639  ABC-3 protein  36.97 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.668793  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0757  ABC-3 protein  35.71 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.422432  normal  0.510372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3197  ABC-3 protein  35.57 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0514778 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  27.84 
 
 		 278 aa  93.6  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  27.84 
 
 		 278 aa  93.6  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0805  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  30.67 
 
 		 266 aa  92.8  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2374  ABC-3 protein  37.5 
 
 		 291 aa  92.8  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192422 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35280  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  36.23 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.74517  normal  0.501768 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  32.5 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0609  ABC-3 protein  32.03 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.746124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0984  ABC-3 protein  36.22 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  27.87 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  31.02 
 
 		 264 aa  86.7  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  28.69 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  27.37 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  30.36 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0354  ABC-3 protein  32.68 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  27.94 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0749  Mn2+/Zn2+ ABC transporter permease  31.97 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.152299  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  26.97 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  26.03 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  28.51 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  31.32 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  28.51 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2088  ABC-3 protein  34.93 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  29.73 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  28.51 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0850  high-affinity zinc uptake system membrane protein ZnuB  31.3 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.714968  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2476  hypothetical protein  32.49 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  28.96 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  29.8 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  29.32 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  26.69 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  27.27 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  29.61 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  26.69 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  26.69 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01359  hypothetical protein  31.82 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  26.69 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2089  ABC-3 protein  31.82 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04290  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  27.6 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  31.42 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3198  ABC-3 protein  31.14 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0525861 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  30.84 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  26.78 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  27.12 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  30.97 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  30.97 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  26.69 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  30.97 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  26.69 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  30.97 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  30.97 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  24.79 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  29.69 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  30.04 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  30.49 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  26.69 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  29.6 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  30.04 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004108  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  30.22 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  30.04 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  30.04 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  26.02 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>