44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7607 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7607  phage integrase family protein  100 
 
 		 248 aa  487  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.484677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  66.95 
 
 		 578 aa  292  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  66.81 
 
 		 580 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  67.8 
 
 		 575 aa  289  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  66.67 
 
 		 578 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  66.23 
 
 		 578 aa  285  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  67.1 
 
 		 578 aa  285  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  67.53 
 
 		 578 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  59.57 
 
 		 563 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  56.13 
 
 		 559 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  55.22 
 
 		 565 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  56.9 
 
 		 563 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  60.87 
 
 		 566 aa  236  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  54.78 
 
 		 565 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  57.66 
 
 		 566 aa  234  9e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  55.65 
 
 		 565 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  57.27 
 
 		 559 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  55.65 
 
 		 565 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  55.65 
 
 		 565 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  55.65 
 
 		 565 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  60.83 
 
 		 559 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  60 
 
 		 566 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  57.75 
 
 		 559 aa  218  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  49.57 
 
 		 565 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  53.91 
 
 		 563 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  55.03 
 
 		 507 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  44.44 
 
 		 580 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  45.37 
 
 		 588 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  52.5 
 
 		 557 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  74.29 
 
 		 442 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  30.22 
 
 		 577 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  40.7 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  33.33 
 
 		 630 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  32.1 
 
 		 716 aa  65.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  29.78 
 
 		 577 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  35.07 
 
 		 618 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  34.38 
 
 		 770 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  35.04 
 
 		 704 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  35.04 
 
 		 704 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  32.85 
 
 		 616 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  29.67 
 
 		 618 aa  55.8  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0343  hypothetical protein  60 
 
 		 113 aa  48.9  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0274665  hitchhiker  0.000359289 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5821  tyrosine-based site-specific recombinase XerD  27.67 
 
 		 526 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  40 
 
 		 609 aa  42  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>