92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7317 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7317  integrase catalytic region  100 
 
 		 374 aa  763    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.0472875 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1084  integrase catalytic region  76.03 
 
 		 494 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310886 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5175  Integrase catalytic region  77.13 
 
 		 477 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3832  integrase catalytic subunit  75.27 
 
 		 496 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322894  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6516  integrase catalytic subunit  75.27 
 
 		 496 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.983833  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0670  putative transposase  79.6 
 
 		 462 aa  554  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0369159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4300  integrase catalytic region  76.62 
 
 		 468 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6204  integrase catalytic region  72.58 
 
 		 496 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1677  integrase catalytic region  72.58 
 
 		 496 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4735  integrase catalytic subunit  69 
 
 		 464 aa  520  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1989  integrase catalytic subunit  69 
 
 		 464 aa  520  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0157211  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1843  transposase  66.86 
 
 		 491 aa  472  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0142418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2121  Integrase catalytic region  63.38 
 
 		 468 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2648  Integrase catalytic region  63.38 
 
 		 468 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1576  transposase  78.11 
 
 		 311 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230399  normal  0.02765 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7305  integrase, catalytic region  77.86 
 
 		 264 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3038  integrase catalytic subunit  69.78 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.158166  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_31  putative phage intergrase  52.7 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6235  Integrase catalytic region  54.27 
 
 		 475 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782279  normal  0.38936 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6205  Integrase catalytic region  54.6 
 
 		 474 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.480184 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5284  Integrase catalytic region  54.6 
 
 		 474 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1969  Integrase catalytic region  54.6 
 
 		 474 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.233913  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1789  Integrase catalytic region  54.85 
 
 		 475 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4409  Integrase catalytic region  54.87 
 
 		 475 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4092  integrase catalytic subunit  55.31 
 
 		 431 aa  381  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5238  integrase catalytic region  52.39 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2654  integrase catalytic region  51.41 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.268588 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5282  Integrase catalytic region  52.05 
 
 		 457 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1967  Integrase catalytic region  52.05 
 
 		 457 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227669  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3937  transposase protein, Y4bF  52.96 
 
 		 458 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6234  Integrase catalytic region  51.23 
 
 		 457 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.416646 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6382  Integrase catalytic region  51.23 
 
 		 457 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.583373 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4886  integrase catalytic region  50.96 
 
 		 457 aa  355  7.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1286  integrase catalytic region  50.96 
 
 		 457 aa  355  7.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.654292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6422  integrase catalytic region  50.68 
 
 		 469 aa  354  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.902721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4696  Integrase catalytic region  50.14 
 
 		 432 aa  353  4e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.019819  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2865  putative transposase  52.81 
 
 		 459 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6517  transposase and inactivated derivatives  85.33 
 
 		 200 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.423171  normal  0.717268 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2069  integrase catalytic region  50.3 
 
 		 437 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6181  integrase, catalytic region  73.79 
 
 		 207 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218221 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7360  integrase catalytic subunit  56.03 
 
 		 339 aa  298  9e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0181906  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5944  integrase, catalytic region  72.45 
 
 		 204 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656636  normal  0.0902484 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3280  integrase catalytic subunit  53.93 
 
 		 317 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.583833  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0039  ISTde1, transposase  37.61 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00960988  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2472  ISTde1, transposase  37.61 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00195439  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2033  ISTde1, transposase  37.61 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.691544  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2352  Sea27  79.37 
 
 		 192 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0980283  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0169  Integrase catalytic region  38.92 
 
 		 434 aa  189  8e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0499  Integrase catalytic region  38.92 
 
 		 434 aa  189  8e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.620267  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1558  hypothetical protein  36.84 
 
 		 401 aa  185  9e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3833  hypothetical protein  68 
 
 		 164 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283519  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0321  integrase catalytic subunit  34.59 
 
 		 462 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.862943  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0950  integrase catalytic subunit  34.34 
 
 		 442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1862  integrase catalytic subunit  34.34 
 
 		 442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1501  integrase catalytic subunit  34.34 
 
 		 442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2830  Integrase catalytic region  32.16 
 
 		 464 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2704  Integrase catalytic region  32.16 
 
 		 454 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2459  Integrase catalytic region  32.16 
 
 		 454 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.319869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2269  Integrase catalytic region  32.16 
 
 		 454 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0737  Integrase catalytic region  32.16 
 
 		 454 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00611369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0527  Integrase catalytic region  32.16 
 
 		 454 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000271735  normal  0.0259964 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0387  Integrase catalytic region  32.16 
 
 		 454 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879221 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0028  Integrase catalytic region  32.16 
 
 		 454 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0185  Integrase catalytic region  32.16 
 
 		 454 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000066025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1565  hypothetical protein  73.12 
 
 		 93 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109766  normal  0.0927482 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0534  putative transposase protein  32.01 
 
 		 450 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1289  putative transposase protein  32.01 
 
 		 450 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1524  putative transposase protein  32.01 
 
 		 450 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.57049  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1648  putative transposase protein  32.01 
 
 		 450 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.581275  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1944  putative transposase protein  32.01 
 
 		 450 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2032  putative transposase protein  32.01 
 
 		 450 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.107643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2513  putative transposase protein  32.01 
 
 		 450 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000581707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2859  putative transposase protein  32.01 
 
 		 450 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3592  putative transposase protein  32.01 
 
 		 450 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0745  putative transposase protein  31.91 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0741  putative transposase protein  31.91 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1842  transposase  59.17 
 
 		 130 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0113266 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01931  probable transposase protein, Y4bF  30.17 
 
 		 494 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02324  hypothetical protein  42.95 
 
 		 153 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3835  hypothetical protein  51.18 
 
 		 148 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.400621 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1712  helix-turn-helix, Fis-type  60.92 
 
 		 93 aa  93.2  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05419  transposase  50.77 
 
 		 71 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6522  transposase and inactivated derivatives  53.62 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6237  integrase, catalytic region  62.75 
 
 		 56 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6630  XRE family transcriptional regulator  67.65 
 
 		 140 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235763  hitchhiker  0.00158501 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  23.81 
 
 		 417 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  23.81 
 
 		 417 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  23.81 
 
 		 417 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0312  Integrase catalytic region  23.72 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  24.76 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  44.23 
 
 		 581 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4349  transposase  44.23 
 
 		 329 aa  42.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>