72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1565 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1565  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  194  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109766  normal  0.0927482 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4300  integrase catalytic region  81.72 
 
 
468 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6204  integrase catalytic region  79.57 
 
 
496 aa  156  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18431  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6516  integrase catalytic subunit  79.57 
 
 
496 aa  156  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.983833  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3832  integrase catalytic subunit  79.57 
 
 
496 aa  156  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322894  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1677  integrase catalytic region  78.49 
 
 
496 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1084  integrase catalytic region  77.42 
 
 
494 aa  155  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.310886 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7317  integrase catalytic region  73.12 
 
 
374 aa  147  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.0472875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5175  Integrase catalytic region  70.97 
 
 
477 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0670  putative transposase  69.89 
 
 
462 aa  134  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0369159  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4735  integrase catalytic subunit  64.13 
 
 
464 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1989  integrase catalytic subunit  64.13 
 
 
464 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0157211  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3038  integrase catalytic subunit  62.64 
 
 
417 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.158166  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6235  Integrase catalytic region  59.78 
 
 
475 aa  120  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782279  normal  0.38936 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1789  Integrase catalytic region  59.78 
 
 
475 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4409  Integrase catalytic region  59.78 
 
 
475 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2121  Integrase catalytic region  64.13 
 
 
468 aa  120  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2648  Integrase catalytic region  64.13 
 
 
468 aa  120  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1969  Integrase catalytic region  58.7 
 
 
474 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.233913  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5284  Integrase catalytic region  58.7 
 
 
474 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6205  Integrase catalytic region  58.7 
 
 
474 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.480184 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1843  transposase  60.44 
 
 
491 aa  116  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0142418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2654  integrase catalytic region  53.76 
 
 
432 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.268588 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5238  integrase catalytic region  53.76 
 
 
432 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_31  putative phage intergrase  57.14 
 
 
445 aa  104  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4092  integrase catalytic subunit  52.81 
 
 
431 aa  102  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3280  integrase catalytic subunit  60.24 
 
 
317 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.583833  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3937  transposase protein, Y4bF  57.83 
 
 
458 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2865  putative transposase  57.83 
 
 
459 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5282  Integrase catalytic region  57.83 
 
 
457 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1967  Integrase catalytic region  57.83 
 
 
457 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227669  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4696  Integrase catalytic region  50 
 
 
432 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.019819  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4886  integrase catalytic region  54.22 
 
 
457 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6422  integrase catalytic region  54.22 
 
 
469 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.902721  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1286  integrase catalytic region  54.22 
 
 
457 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.654292  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6234  Integrase catalytic region  53.66 
 
 
457 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.416646 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6382  Integrase catalytic region  53.66 
 
 
457 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.583373 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2069  integrase catalytic region  51.9 
 
 
437 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1576  transposase  84.09 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230399  normal  0.02765 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1501  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 
442 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0169  Integrase catalytic region  43.96 
 
 
434 aa  75.9  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0499  Integrase catalytic region  43.96 
 
 
434 aa  75.9  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.620267  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1862  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 
442 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0950  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 
442 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0321  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 
462 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.862943  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7360  integrase catalytic subunit  58.33 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0181906  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1558  hypothetical protein  48.15 
 
 
401 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7305  integrase, catalytic region  84.85 
 
 
264 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00306385 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2033  ISTde1, transposase  36.36 
 
 
394 aa  56.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.691544  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2472  ISTde1, transposase  36.36 
 
 
394 aa  56.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00195439  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0039  ISTde1, transposase  36.36 
 
 
394 aa  56.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00960988  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0527  Integrase catalytic region  36.96 
 
 
454 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000271735  normal  0.0259964 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0028  Integrase catalytic region  36.96 
 
 
454 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0185  Integrase catalytic region  36.96 
 
 
454 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000066025  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2704  Integrase catalytic region  36.96 
 
 
454 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0387  Integrase catalytic region  36.96 
 
 
454 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00879221 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0737  Integrase catalytic region  36.96 
 
 
454 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00611369  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2269  Integrase catalytic region  36.96 
 
 
454 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2459  Integrase catalytic region  36.96 
 
 
454 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.319869  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2830  Integrase catalytic region  36.96 
 
 
464 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3592  putative transposase protein  35.87 
 
 
450 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2859  putative transposase protein  35.87 
 
 
450 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2513  putative transposase protein  35.87 
 
 
450 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000581707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2032  putative transposase protein  35.87 
 
 
450 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.107643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1944  putative transposase protein  35.87 
 
 
450 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1648  putative transposase protein  35.87 
 
 
450 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.581275  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1524  putative transposase protein  35.87 
 
 
450 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.57049  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1289  putative transposase protein  35.87 
 
 
450 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0745  putative transposase protein  35.87 
 
 
442 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0741  putative transposase protein  35.87 
 
 
442 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0534  putative transposase protein  35.87 
 
 
450 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01931  probable transposase protein, Y4bF  30.61 
 
 
494 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>