94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0670 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3832  integrase catalytic subunit  72.87 
 
 		 496 aa  660    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322894  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1677  integrase catalytic region  70.85 
 
 		 496 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6204  integrase catalytic region  70.85 
 
 		 496 aa  639    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6516  integrase catalytic subunit  72.87 
 
 		 496 aa  660    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.983833  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1084  integrase catalytic region  72.52 
 
 		 494 aa  662    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310886 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0670  putative transposase  100 
 
 		 462 aa  943    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0369159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4300  integrase catalytic region  72.07 
 
 		 468 aa  668    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5175  Integrase catalytic region  69.82 
 
 		 477 aa  621  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4735  integrase catalytic subunit  64.86 
 
 		 464 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1989  integrase catalytic subunit  64.86 
 
 		 464 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0157211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7317  integrase catalytic region  79.6 
 
 		 374 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.0472875 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1843  transposase  64.19 
 
 		 491 aa  564  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0142418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2121  Integrase catalytic region  58.53 
 
 		 468 aa  552  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2648  Integrase catalytic region  58.53 
 
 		 468 aa  552  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3038  integrase catalytic subunit  67.38 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.158166  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1969  Integrase catalytic region  54.09 
 
 		 474 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.233913  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6235  Integrase catalytic region  54.57 
 
 		 475 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782279  normal  0.38936 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5284  Integrase catalytic region  54.09 
 
 		 474 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6205  Integrase catalytic region  54.09 
 
 		 474 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.480184 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1576  transposase  81.09 
 
 		 311 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230399  normal  0.02765 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_31  putative phage intergrase  51.85 
 
 		 445 aa  449  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4409  Integrase catalytic region  54.33 
 
 		 475 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1789  Integrase catalytic region  54.33 
 
 		 475 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4092  integrase catalytic subunit  52.66 
 
 		 431 aa  425  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5238  integrase catalytic region  48.32 
 
 		 432 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2654  integrase catalytic region  49.25 
 
 		 432 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.268588 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7305  integrase, catalytic region  79.76 
 
 		 264 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306385 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4696  Integrase catalytic region  49.4 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.019819  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3937  transposase protein, Y4bF  47.1 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2865  putative transposase  46.99 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5282  Integrase catalytic region  48.98 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4886  integrase catalytic region  48.01 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6422  integrase catalytic region  47.76 
 
 		 469 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.902721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1286  integrase catalytic region  48.01 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.654292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1967  Integrase catalytic region  48.98 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227669  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6382  Integrase catalytic region  46.01 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.583373 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6234  Integrase catalytic region  46.01 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.416646 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6517  transposase and inactivated derivatives  77.83 
 
 		 200 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.423171  normal  0.717268 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6181  integrase, catalytic region  83.24 
 
 		 207 aa  316  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218221 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2069  integrase catalytic region  45.01 
 
 		 437 aa  306  7e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5944  integrase, catalytic region  77.42 
 
 		 204 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656636  normal  0.0902484 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7360  integrase catalytic subunit  55.43 
 
 		 339 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0181906  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3280  integrase catalytic subunit  51.92 
 
 		 317 aa  263  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.583833  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2352  Sea27  82.26 
 
 		 192 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0980283  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0039  ISTde1, transposase  34.29 
 
 		 394 aa  202  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00960988  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2472  ISTde1, transposase  34.29 
 
 		 394 aa  202  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00195439  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2033  ISTde1, transposase  34.29 
 
 		 394 aa  202  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.691544  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0499  Integrase catalytic region  36.8 
 
 		 434 aa  186  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.620267  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0169  Integrase catalytic region  36.8 
 
 		 434 aa  186  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1558  hypothetical protein  35.53 
 
 		 401 aa  173  5e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3833  hypothetical protein  70.43 
 
 		 164 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283519  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2704  Integrase catalytic region  31.07 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0527  Integrase catalytic region  31.07 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000271735  normal  0.0259964 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0387  Integrase catalytic region  31.07 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879221 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0185  Integrase catalytic region  31.07 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000066025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0028  Integrase catalytic region  31.07 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0737  Integrase catalytic region  31.07 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00611369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2269  Integrase catalytic region  31.07 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2459  Integrase catalytic region  31.07 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.319869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2830  Integrase catalytic region  31.07 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1862  integrase catalytic subunit  32.56 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0321  integrase catalytic subunit  32.56 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.862943  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0950  integrase catalytic subunit  32.56 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1501  integrase catalytic subunit  32.56 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2032  putative transposase protein  31.59 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.107643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2859  putative transposase protein  31.59 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1944  putative transposase protein  31.59 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1648  putative transposase protein  31.59 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.581275  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1524  putative transposase protein  31.59 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.57049  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1289  putative transposase protein  31.59 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0745  putative transposase protein  31.59 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0741  putative transposase protein  31.59 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0534  putative transposase protein  31.59 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2513  putative transposase protein  31.59 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000581707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3592  putative transposase protein  31.59 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1565  hypothetical protein  69.89 
 
 		 93 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109766  normal  0.0927482 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1842  transposase  60 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0113266 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3835  hypothetical protein  59.62 
 
 		 148 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.400621 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02324  hypothetical protein  41.55 
 
 		 153 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01931  probable transposase protein, Y4bF  27.62 
 
 		 494 aa  120  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1712  helix-turn-helix, Fis-type  64.94 
 
 		 93 aa  94.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4621  hypothetical protein  50.57 
 
 		 195 aa  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05419  transposase  54.84 
 
 		 71 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6630  XRE family transcriptional regulator  73.53 
 
 		 140 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235763  hitchhiker  0.00158501 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6522  transposase and inactivated derivatives  69.23 
 
 		 90 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6237  integrase, catalytic region  68.29 
 
 		 56 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  23.7 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  23.7 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1746  putative transposase protein  52.38 
 
 		 79 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.318345  normal  0.112215 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  23.7 
 
 		 417 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  23.15 
 
 		 555 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  39.34 
 
 		 581 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  23.69 
 
 		 558 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  23.69 
 
 		 558 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>