26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6237 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6237  integrase, catalytic region  100 
 
 		 56 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1677  integrase catalytic region  96.08 
 
 		 496 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6204  integrase catalytic region  96.08 
 
 		 496 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3832  integrase catalytic subunit  96.08 
 
 		 496 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322894  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6516  integrase catalytic subunit  96.08 
 
 		 496 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.983833  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5944  integrase, catalytic region  96.08 
 
 		 204 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656636  normal  0.0902484 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7305  integrase, catalytic region  86.27 
 
 		 264 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306385 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1084  integrase catalytic region  86.27 
 
 		 494 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310886 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6181  integrase, catalytic region  86.05 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218221 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3835  hypothetical protein  83.72 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.400621 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7317  integrase catalytic region  62.75 
 
 		 374 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.0472875 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1712  helix-turn-helix, Fis-type  64 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1842  transposase  62.75 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0113266 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3833  hypothetical protein  61.36 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283519  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1576  transposase  66.67 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230399  normal  0.02765 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2352  Sea27  71.43 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0980283  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1843  transposase  58.82 
 
 		 491 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0142418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4300  integrase catalytic region  58.14 
 
 		 468 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05419  transposase  60 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0670  putative transposase  68.29 
 
 		 462 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0369159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6517  transposase and inactivated derivatives  68.29 
 
 		 200 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.423171  normal  0.717268 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5175  Integrase catalytic region  55.56 
 
 		 477 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2121  Integrase catalytic region  48 
 
 		 468 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2648  Integrase catalytic region  48 
 
 		 468 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1989  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 464 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0157211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4735  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 464 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>