83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3833 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3833  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  331  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283519  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4300  integrase catalytic region  96.55 
 
 		 468 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7305  integrase, catalytic region  72.27 
 
 		 264 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306385 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1084  integrase catalytic region  72.27 
 
 		 494 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310886 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1576  transposase  70.16 
 
 		 311 aa  176  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230399  normal  0.02765 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6181  integrase, catalytic region  70.09 
 
 		 207 aa  175  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218221 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7317  integrase catalytic region  68 
 
 		 374 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.0472875 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2352  Sea27  70.09 
 
 		 192 aa  168  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0980283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1677  integrase catalytic region  68.07 
 
 		 496 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5175  Integrase catalytic region  66.4 
 
 		 477 aa  167  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6204  integrase catalytic region  68.07 
 
 		 496 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6516  integrase catalytic subunit  68.07 
 
 		 496 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.983833  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3832  integrase catalytic subunit  68.07 
 
 		 496 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322894  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6517  transposase and inactivated derivatives  69.57 
 
 		 200 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.423171  normal  0.717268 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5944  integrase, catalytic region  68.07 
 
 		 204 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656636  normal  0.0902484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1843  transposase  62.4 
 
 		 491 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0142418 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0670  putative transposase  70.43 
 
 		 462 aa  157  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0369159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2648  Integrase catalytic region  63.25 
 
 		 468 aa  156  9e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2121  Integrase catalytic region  63.25 
 
 		 468 aa  156  9e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1989  integrase catalytic subunit  61.07 
 
 		 464 aa  153  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0157211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4735  integrase catalytic subunit  61.07 
 
 		 464 aa  153  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1842  transposase  58.33 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0113266 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6235  Integrase catalytic region  53.78 
 
 		 475 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782279  normal  0.38936 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1789  Integrase catalytic region  53.78 
 
 		 475 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6205  Integrase catalytic region  52.94 
 
 		 474 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.480184 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1969  Integrase catalytic region  52.94 
 
 		 474 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.233913  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5284  Integrase catalytic region  52.94 
 
 		 474 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4409  Integrase catalytic region  52.94 
 
 		 475 aa  121  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2069  integrase catalytic region  49.57 
 
 		 437 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4696  Integrase catalytic region  48.33 
 
 		 432 aa  117  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.019819  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_31  putative phage intergrase  43.7 
 
 		 445 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6422  integrase catalytic region  44.7 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.902721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4886  integrase catalytic region  44.7 
 
 		 457 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1286  integrase catalytic region  44.7 
 
 		 457 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.654292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2654  integrase catalytic region  48.31 
 
 		 432 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.268588 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5238  integrase catalytic region  47.83 
 
 		 432 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6234  Integrase catalytic region  42.42 
 
 		 457 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.416646 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6382  Integrase catalytic region  42.42 
 
 		 457 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.583373 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3835  hypothetical protein  52.83 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.400621 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1967  Integrase catalytic region  42.42 
 
 		 457 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227669  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7360  integrase catalytic subunit  43.18 
 
 		 339 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0181906  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5282  Integrase catalytic region  42.42 
 
 		 457 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3937  transposase protein, Y4bF  43.18 
 
 		 458 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2865  putative transposase  43.18 
 
 		 459 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1712  helix-turn-helix, Fis-type  60.92 
 
 		 93 aa  104  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4092  integrase catalytic subunit  46.61 
 
 		 431 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2033  ISTde1, transposase  38.46 
 
 		 394 aa  90.5  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.691544  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0039  ISTde1, transposase  38.46 
 
 		 394 aa  90.5  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00960988  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2472  ISTde1, transposase  38.46 
 
 		 394 aa  90.5  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00195439  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02324  hypothetical protein  36.67 
 
 		 153 aa  88.2  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1558  hypothetical protein  37.82 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2830  Integrase catalytic region  28.95 
 
 		 464 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2459  Integrase catalytic region  28.95 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.319869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2269  Integrase catalytic region  28.95 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0737  Integrase catalytic region  28.95 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00611369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0527  Integrase catalytic region  28.95 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000271735  normal  0.0259964 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0387  Integrase catalytic region  28.95 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879221 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0185  Integrase catalytic region  28.95 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000066025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0028  Integrase catalytic region  28.95 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2704  Integrase catalytic region  28.95 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05419  transposase  44.93 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6237  integrase, catalytic region  61.36 
 
 		 56 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0499  Integrase catalytic region  32.17 
 
 		 434 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.620267  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0169  Integrase catalytic region  32.17 
 
 		 434 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1862  integrase catalytic subunit  29.82 
 
 		 442 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1501  integrase catalytic subunit  29.82 
 
 		 442 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0950  integrase catalytic subunit  29.82 
 
 		 442 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0321  integrase catalytic subunit  28.81 
 
 		 462 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.862943  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01931  probable transposase protein, Y4bF  32.69 
 
 		 494 aa  50.8  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3592  putative transposase protein  25.4 
 
 		 450 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0534  putative transposase protein  25.4 
 
 		 450 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1289  putative transposase protein  25.4 
 
 		 450 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1524  putative transposase protein  25.4 
 
 		 450 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.57049  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1648  putative transposase protein  25.4 
 
 		 450 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.581275  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1944  putative transposase protein  25.4 
 
 		 450 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2032  putative transposase protein  25.4 
 
 		 450 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.107643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2513  putative transposase protein  25.4 
 
 		 450 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000581707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2859  putative transposase protein  25.4 
 
 		 450 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0745  putative transposase protein  25.42 
 
 		 442 aa  48.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0741  putative transposase protein  25.42 
 
 		 442 aa  48.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3038  integrase catalytic subunit  62.96 
 
 		 417 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.158166  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02143  hypothetical protein  48.78 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2821  transcriptional regulator  47.73 
 
 		 324 aa  40.8  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>