79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02324 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02324  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  316  9e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_31  putative phage intergrase  46.67 
 
 		 445 aa  154  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5238  integrase catalytic region  47.95 
 
 		 432 aa  147  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6205  Integrase catalytic region  46 
 
 		 474 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.480184 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1969  Integrase catalytic region  46 
 
 		 474 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.233913  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5284  Integrase catalytic region  46 
 
 		 474 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6235  Integrase catalytic region  46.31 
 
 		 475 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782279  normal  0.38936 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1789  Integrase catalytic region  45.64 
 
 		 475 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4409  Integrase catalytic region  44.67 
 
 		 475 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1576  transposase  44.97 
 
 		 311 aa  140  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230399  normal  0.02765 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7305  integrase, catalytic region  44.59 
 
 		 264 aa  140  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306385 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6181  integrase, catalytic region  43.84 
 
 		 207 aa  137  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218221 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2121  Integrase catalytic region  44.3 
 
 		 468 aa  136  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2648  Integrase catalytic region  44.3 
 
 		 468 aa  136  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4696  Integrase catalytic region  42.28 
 
 		 432 aa  136  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.019819  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5944  integrase, catalytic region  45.27 
 
 		 204 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656636  normal  0.0902484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2654  integrase catalytic region  42.28 
 
 		 432 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.268588 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1084  integrase catalytic region  44.59 
 
 		 494 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310886 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4735  integrase catalytic subunit  42.95 
 
 		 464 aa  134  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1989  integrase catalytic subunit  42.95 
 
 		 464 aa  134  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0157211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7360  integrase catalytic subunit  44.59 
 
 		 339 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0181906  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6516  integrase catalytic subunit  45.27 
 
 		 496 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.983833  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3832  integrase catalytic subunit  45.27 
 
 		 496 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322894  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6204  integrase catalytic region  45.27 
 
 		 496 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1677  integrase catalytic region  45.27 
 
 		 496 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5175  Integrase catalytic region  42.28 
 
 		 477 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2865  putative transposase  44.59 
 
 		 459 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3937  transposase protein, Y4bF  44.59 
 
 		 458 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1967  Integrase catalytic region  41.61 
 
 		 457 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227669  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5282  Integrase catalytic region  41.61 
 
 		 457 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4886  integrase catalytic region  41.61 
 
 		 457 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1286  integrase catalytic region  41.61 
 
 		 457 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.654292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7317  integrase catalytic region  42.95 
 
 		 374 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.0472875 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6422  integrase catalytic region  42 
 
 		 469 aa  127  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.902721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6517  transposase and inactivated derivatives  43.66 
 
 		 200 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.423171  normal  0.717268 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6234  Integrase catalytic region  41.61 
 
 		 457 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.416646 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6382  Integrase catalytic region  41.61 
 
 		 457 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.583373 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4092  integrase catalytic subunit  39.6 
 
 		 431 aa  125  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4300  integrase catalytic region  42.47 
 
 		 468 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1843  transposase  43.24 
 
 		 491 aa  117  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0142418 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2069  integrase catalytic region  40.54 
 
 		 437 aa  115  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0670  putative transposase  41.55 
 
 		 462 aa  114  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0369159  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2033  ISTde1, transposase  37.84 
 
 		 394 aa  97.8  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.691544  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2472  ISTde1, transposase  37.84 
 
 		 394 aa  97.8  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00195439  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0039  ISTde1, transposase  37.84 
 
 		 394 aa  97.8  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00960988  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2352  Sea27  37.3 
 
 		 192 aa  94.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0980283  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3833  hypothetical protein  36.67 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283519  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1558  hypothetical protein  34.9 
 
 		 401 aa  85.5  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3038  integrase catalytic subunit  53.57 
 
 		 417 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.158166  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1842  transposase  33.94 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0113266 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3280  integrase catalytic subunit  53.33 
 
 		 317 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.583833  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3835  hypothetical protein  33.96 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.400621 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2859  putative transposase protein  25.34 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2513  putative transposase protein  25.34 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000581707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2032  putative transposase protein  25.34 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.107643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1944  putative transposase protein  25.34 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1648  putative transposase protein  25.34 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.581275  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1524  putative transposase protein  25.34 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.57049  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1289  putative transposase protein  25.34 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3592  putative transposase protein  25.34 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0534  putative transposase protein  25.34 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0741  putative transposase protein  25 
 
 		 442 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0745  putative transposase protein  25 
 
 		 442 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0950  integrase catalytic subunit  29.82 
 
 		 442 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1501  integrase catalytic subunit  29.82 
 
 		 442 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1862  integrase catalytic subunit  29.82 
 
 		 442 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0321  integrase catalytic subunit  29.31 
 
 		 462 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.862943  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2830  Integrase catalytic region  28.77 
 
 		 464 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2704  Integrase catalytic region  28.77 
 
 		 454 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2459  Integrase catalytic region  28.77 
 
 		 454 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.319869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2269  Integrase catalytic region  28.77 
 
 		 454 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0737  Integrase catalytic region  28.77 
 
 		 454 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00611369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0527  Integrase catalytic region  28.77 
 
 		 454 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000271735  normal  0.0259964 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0387  Integrase catalytic region  28.77 
 
 		 454 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879221 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0185  Integrase catalytic region  28.77 
 
 		 454 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000066025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0028  Integrase catalytic region  28.77 
 
 		 454 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0169  Integrase catalytic region  27.59 
 
 		 434 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0499  Integrase catalytic region  27.59 
 
 		 434 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.620267  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01931  probable transposase protein, Y4bF  29.58 
 
 		 494 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>