123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0499 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0169  Integrase catalytic region  100 
 
 
434 aa  884    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0499  Integrase catalytic region  100 
 
 
434 aa  884    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.620267  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0950  integrase catalytic subunit  46.39 
 
 
442 aa  345  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1501  integrase catalytic subunit  46.39 
 
 
442 aa  345  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1862  integrase catalytic subunit  46.39 
 
 
442 aa  345  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0321  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 
462 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.862943  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2830  Integrase catalytic region  45.13 
 
 
464 aa  326  4.0000000000000003e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0028  Integrase catalytic region  45.13 
 
 
454 aa  326  5e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0185  Integrase catalytic region  45.13 
 
 
454 aa  326  5e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000066025  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0387  Integrase catalytic region  45.13 
 
 
454 aa  326  5e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00879221 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0527  Integrase catalytic region  45.13 
 
 
454 aa  326  5e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000271735  normal  0.0259964 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0737  Integrase catalytic region  45.13 
 
 
454 aa  326  5e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00611369  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2269  Integrase catalytic region  45.13 
 
 
454 aa  326  5e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2459  Integrase catalytic region  45.13 
 
 
454 aa  326  5e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.319869  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2704  Integrase catalytic region  45.13 
 
 
454 aa  326  5e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0534  putative transposase protein  41.43 
 
 
450 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0741  putative transposase protein  41.43 
 
 
442 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0745  putative transposase protein  41.43 
 
 
442 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1289  putative transposase protein  41.43 
 
 
450 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1524  putative transposase protein  41.43 
 
 
450 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.57049  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1648  putative transposase protein  41.43 
 
 
450 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.581275  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1944  putative transposase protein  41.43 
 
 
450 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2032  putative transposase protein  41.43 
 
 
450 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.107643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2513  putative transposase protein  41.43 
 
 
450 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000581707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2859  putative transposase protein  41.43 
 
 
450 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3592  putative transposase protein  41.43 
 
 
450 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1843  transposase  39.3 
 
 
491 aa  221  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0142418 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6235  Integrase catalytic region  37.43 
 
 
475 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782279  normal  0.38936 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6382  Integrase catalytic region  38.17 
 
 
457 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.583373 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6234  Integrase catalytic region  38.17 
 
 
457 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.416646 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4886  integrase catalytic region  38.4 
 
 
457 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1286  integrase catalytic region  38.4 
 
 
457 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.654292  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2654  integrase catalytic region  36.76 
 
 
432 aa  212  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.268588 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1967  Integrase catalytic region  38.97 
 
 
457 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227669  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5282  Integrase catalytic region  38.97 
 
 
457 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6422  integrase catalytic region  38.11 
 
 
469 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.902721  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4409  Integrase catalytic region  37.15 
 
 
475 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1789  Integrase catalytic region  37.15 
 
 
475 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3937  transposase protein, Y4bF  38.79 
 
 
458 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6205  Integrase catalytic region  36.87 
 
 
474 aa  210  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.480184 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1969  Integrase catalytic region  36.87 
 
 
474 aa  210  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.233913  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5284  Integrase catalytic region  36.87 
 
 
474 aa  210  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5175  Integrase catalytic region  40 
 
 
477 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2069  integrase catalytic region  34.04 
 
 
437 aa  207  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2865  putative transposase  38.68 
 
 
459 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5238  integrase catalytic region  35.68 
 
 
432 aa  206  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4300  integrase catalytic region  37.24 
 
 
468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4092  integrase catalytic subunit  35.36 
 
 
431 aa  197  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4735  integrase catalytic subunit  38.62 
 
 
464 aa  196  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1989  integrase catalytic subunit  38.62 
 
 
464 aa  196  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0157211  normal 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_31  putative phage intergrase  34.26 
 
 
445 aa  194  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4696  Integrase catalytic region  34.86 
 
 
432 aa  193  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.019819  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2121  Integrase catalytic region  33.79 
 
 
468 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2648  Integrase catalytic region  33.79 
 
 
468 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1084  integrase catalytic region  36.36 
 
 
494 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.310886 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7317  integrase catalytic region  38.92 
 
 
374 aa  189  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.0472875 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3832  integrase catalytic subunit  35.19 
 
 
496 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322894  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6516  integrase catalytic subunit  35.19 
 
 
496 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.983833  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0039  ISTde1, transposase  31.43 
 
 
394 aa  184  3e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00960988  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2033  ISTde1, transposase  31.43 
 
 
394 aa  184  3e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.691544  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2472  ISTde1, transposase  31.43 
 
 
394 aa  184  3e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00195439  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0670  putative transposase  36.8 
 
 
462 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0369159  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1677  integrase catalytic region  34.31 
 
 
496 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6204  integrase catalytic region  34.31 
 
 
496 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18431  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01931  probable transposase protein, Y4bF  35.01 
 
 
494 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3280  integrase catalytic subunit  39.37 
 
 
317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.583833  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1558  hypothetical protein  32.79 
 
 
401 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7360  integrase catalytic subunit  37.5 
 
 
339 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0181906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3038  integrase catalytic subunit  39.18 
 
 
417 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.158166  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1576  transposase  36.19 
 
 
311 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230399  normal  0.02765 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7305  integrase, catalytic region  34.73 
 
 
264 aa  131  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00306385 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6517  transposase and inactivated derivatives  33.51 
 
 
200 aa  93.2  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.423171  normal  0.717268 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6181  integrase, catalytic region  32.23 
 
 
207 aa  93.2  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00218221 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5944  integrase, catalytic region  31.18 
 
 
204 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656636  normal  0.0902484 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1565  hypothetical protein  43.96 
 
 
93 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109766  normal  0.0927482 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  26.47 
 
 
417 aa  63.2  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  26.47 
 
 
417 aa  63.2  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0312  Integrase catalytic region  25.89 
 
 
416 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  26.47 
 
 
417 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0381  integrase catalytic subunit  27.32 
 
 
441 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0544  integrase catalytic subunit  27.32 
 
 
441 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.265235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1107  integrase catalytic subunit  27.32 
 
 
441 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.515553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1874  integrase catalytic subunit  27.32 
 
 
441 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1842  transposase  35.48 
 
 
130 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0113266 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0795  Integrase catalytic region  23.57 
 
 
425 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3833  hypothetical protein  32.17 
 
 
164 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283519  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0622  integrase catalytic subunit  23.27 
 
 
426 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1731  integrase catalytic subunit  23.27 
 
 
426 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.742948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0635  integrase catalytic subunit  23.27 
 
 
426 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1778  integrase catalytic subunit  23.27 
 
 
426 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.12662  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1710  integrase catalytic subunit  23.27 
 
 
426 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2352  Sea27  30.71 
 
 
192 aa  53.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0980283  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0615  integrase catalytic subunit  23.27 
 
 
307 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04580  integrase family protein  22.96 
 
 
434 aa  51.2  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0532  integrase catalytic subunit  25.23 
 
 
459 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28440  integrase family protein  22.96 
 
 
434 aa  50.8  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1105  integrase catalytic subunit  27.82 
 
 
426 aa  50.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0473204  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3239  integrase catalytic subunit  24.78 
 
 
330 aa  49.7  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1285  integrase catalytic subunit  25.47 
 
 
459 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2257  integrase catalytic subunit  25.47 
 
 
459 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>