68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2352 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I2352  Sea27  100 
 
 		 192 aa  378  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0980283  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6517  transposase and inactivated derivatives  95.45 
 
 		 200 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.423171  normal  0.717268 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7317  integrase catalytic region  79.85 
 
 		 374 aa  222  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.0472875 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1084  integrase catalytic region  81.34 
 
 		 494 aa  221  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310886 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1576  transposase  81.34 
 
 		 311 aa  220  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230399  normal  0.02765 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7305  integrase, catalytic region  81.34 
 
 		 264 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306385 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6181  integrase, catalytic region  81.34 
 
 		 207 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218221 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0670  putative transposase  82.58 
 
 		 462 aa  210  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0369159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6516  integrase catalytic subunit  74.63 
 
 		 496 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.983833  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3832  integrase catalytic subunit  74.63 
 
 		 496 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322894  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6204  integrase catalytic region  73.88 
 
 		 496 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1677  integrase catalytic region  73.88 
 
 		 496 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5944  integrase, catalytic region  73.88 
 
 		 204 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656636  normal  0.0902484 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4300  integrase catalytic region  69.4 
 
 		 468 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1843  transposase  65.67 
 
 		 491 aa  176  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0142418 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1989  integrase catalytic subunit  63.43 
 
 		 464 aa  173  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0157211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4735  integrase catalytic subunit  63.43 
 
 		 464 aa  173  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3833  hypothetical protein  70.09 
 
 		 164 aa  168  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283519  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5175  Integrase catalytic region  63.91 
 
 		 477 aa  168  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2648  Integrase catalytic region  58.96 
 
 		 468 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2121  Integrase catalytic region  58.96 
 
 		 468 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1969  Integrase catalytic region  52.24 
 
 		 474 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.233913  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6205  Integrase catalytic region  52.24 
 
 		 474 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.480184 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5284  Integrase catalytic region  52.24 
 
 		 474 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_31  putative phage intergrase  49.24 
 
 		 445 aa  135  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1842  transposase  62.5 
 
 		 130 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0113266 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6235  Integrase catalytic region  50 
 
 		 475 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782279  normal  0.38936 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4409  Integrase catalytic region  49.25 
 
 		 475 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1789  Integrase catalytic region  49.25 
 
 		 475 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5238  integrase catalytic region  49.25 
 
 		 432 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2654  integrase catalytic region  49.25 
 
 		 432 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.268588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4696  Integrase catalytic region  46.97 
 
 		 432 aa  120  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.019819  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2069  integrase catalytic region  44.7 
 
 		 437 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3835  hypothetical protein  59.43 
 
 		 148 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.400621 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4092  integrase catalytic subunit  47.01 
 
 		 431 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4886  integrase catalytic region  43.94 
 
 		 457 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1286  integrase catalytic region  43.94 
 
 		 457 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.654292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6422  integrase catalytic region  43.18 
 
 		 469 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.902721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02324  hypothetical protein  38.81 
 
 		 153 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6234  Integrase catalytic region  43.18 
 
 		 457 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.416646 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6382  Integrase catalytic region  43.18 
 
 		 457 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.583373 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7360  integrase catalytic subunit  42.42 
 
 		 339 aa  99.8  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0181906  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3937  transposase protein, Y4bF  42.42 
 
 		 458 aa  99.8  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2865  putative transposase  42.42 
 
 		 459 aa  99.8  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1967  Integrase catalytic region  40.15 
 
 		 457 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227669  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5282  Integrase catalytic region  40.15 
 
 		 457 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1712  helix-turn-helix, Fis-type  64.56 
 
 		 93 aa  88.2  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2033  ISTde1, transposase  37.39 
 
 		 394 aa  86.3  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.691544  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0039  ISTde1, transposase  37.39 
 
 		 394 aa  86.3  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00960988  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2472  ISTde1, transposase  37.39 
 
 		 394 aa  86.3  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00195439  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3038  integrase catalytic subunit  68.18 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.158166  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05419  transposase  53.12 
 
 		 71 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1558  hypothetical protein  34.56 
 
 		 401 aa  62.8  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0745  putative transposase protein  32.03 
 
 		 442 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0741  putative transposase protein  32.03 
 
 		 442 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1648  putative transposase protein  32.03 
 
 		 450 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.581275  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1524  putative transposase protein  32.03 
 
 		 450 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.57049  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1289  putative transposase protein  32.03 
 
 		 450 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1944  putative transposase protein  32.03 
 
 		 450 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0534  putative transposase protein  32.03 
 
 		 450 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2032  putative transposase protein  32.03 
 
 		 450 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.107643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2513  putative transposase protein  32.03 
 
 		 450 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000581707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2859  putative transposase protein  32.03 
 
 		 450 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3592  putative transposase protein  32.03 
 
 		 450 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0169  Integrase catalytic region  31.82 
 
 		 434 aa  55.1  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0499  Integrase catalytic region  31.82 
 
 		 434 aa  55.1  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.620267  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6237  integrase, catalytic region  71.43 
 
 		 56 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  40.91 
 
 		 581 aa  45.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>