105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2859 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0534  putative transposase protein  100 
 
 		 450 aa  919    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0741  putative transposase protein  100 
 
 		 442 aa  903    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0745  putative transposase protein  100 
 
 		 442 aa  903    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1289  putative transposase protein  100 
 
 		 450 aa  919    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1524  putative transposase protein  100 
 
 		 450 aa  919    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.57049  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1648  putative transposase protein  100 
 
 		 450 aa  919    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.581275  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1944  putative transposase protein  100 
 
 		 450 aa  919    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2032  putative transposase protein  100 
 
 		 450 aa  919    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.107643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2513  putative transposase protein  100 
 
 		 450 aa  919    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000581707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2859  putative transposase protein  100 
 
 		 450 aa  919    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3592  putative transposase protein  100 
 
 		 450 aa  919    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0499  Integrase catalytic region  41.9 
 
 		 434 aa  300  4e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.620267  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0169  Integrase catalytic region  41.9 
 
 		 434 aa  300  4e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0321  integrase catalytic subunit  40.49 
 
 		 462 aa  298  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.862943  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0950  integrase catalytic subunit  40.5 
 
 		 442 aa  292  8e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1501  integrase catalytic subunit  40.5 
 
 		 442 aa  292  8e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1862  integrase catalytic subunit  40.5 
 
 		 442 aa  292  8e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0028  Integrase catalytic region  39.5 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0185  Integrase catalytic region  39.5 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000066025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0387  Integrase catalytic region  39.5 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879221 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0527  Integrase catalytic region  39.5 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000271735  normal  0.0259964 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0737  Integrase catalytic region  39.5 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00611369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2269  Integrase catalytic region  39.5 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2459  Integrase catalytic region  39.5 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.319869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2704  Integrase catalytic region  39.5 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2830  Integrase catalytic region  39.5 
 
 		 464 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2069  integrase catalytic region  35.61 
 
 		 437 aa  184  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_31  putative phage intergrase  32.11 
 
 		 445 aa  178  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6234  Integrase catalytic region  35.41 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.416646 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6382  Integrase catalytic region  35.41 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.583373 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4300  integrase catalytic region  31.25 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5175  Integrase catalytic region  31.64 
 
 		 477 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5282  Integrase catalytic region  33.81 
 
 		 457 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1967  Integrase catalytic region  33.81 
 
 		 457 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227669  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4886  integrase catalytic region  33.71 
 
 		 457 aa  163  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1286  integrase catalytic region  33.71 
 
 		 457 aa  163  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.654292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6422  integrase catalytic region  33.71 
 
 		 469 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.902721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1084  integrase catalytic region  32.46 
 
 		 494 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310886 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4696  Integrase catalytic region  32.35 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.019819  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1843  transposase  30.71 
 
 		 491 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0142418 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3832  integrase catalytic subunit  31.17 
 
 		 496 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322894  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6516  integrase catalytic subunit  31.17 
 
 		 496 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.983833  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1558  hypothetical protein  30.75 
 
 		 401 aa  157  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5284  Integrase catalytic region  31.33 
 
 		 474 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1969  Integrase catalytic region  31.33 
 
 		 474 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.233913  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6205  Integrase catalytic region  31.33 
 
 		 474 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.480184 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4735  integrase catalytic subunit  32.9 
 
 		 464 aa  155  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1989  integrase catalytic subunit  32.9 
 
 		 464 aa  155  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0157211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2654  integrase catalytic region  33.02 
 
 		 432 aa  153  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.268588 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3937  transposase protein, Y4bF  32.39 
 
 		 458 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2865  putative transposase  32.3 
 
 		 459 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5238  integrase catalytic region  32.4 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6235  Integrase catalytic region  30.03 
 
 		 475 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782279  normal  0.38936 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2121  Integrase catalytic region  29.6 
 
 		 468 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2648  Integrase catalytic region  29.6 
 
 		 468 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4409  Integrase catalytic region  30.03 
 
 		 475 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6204  integrase catalytic region  31.77 
 
 		 496 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1789  Integrase catalytic region  29.77 
 
 		 475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1677  integrase catalytic region  31.49 
 
 		 496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7317  integrase catalytic region  32.04 
 
 		 374 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.0472875 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0039  ISTde1, transposase  29.59 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00960988  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2033  ISTde1, transposase  29.59 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.691544  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2472  ISTde1, transposase  29.59 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00195439  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4092  integrase catalytic subunit  31.22 
 
 		 431 aa  144  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0670  putative transposase  32.11 
 
 		 462 aa  143  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0369159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3038  integrase catalytic subunit  32.19 
 
 		 417 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.158166  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3280  integrase catalytic subunit  35.36 
 
 		 317 aa  131  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.583833  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7360  integrase catalytic subunit  32.97 
 
 		 339 aa  123  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0181906  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7305  integrase, catalytic region  32.96 
 
 		 264 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306385 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1576  transposase  32.39 
 
 		 311 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230399  normal  0.02765 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01931  probable transposase protein, Y4bF  26.27 
 
 		 494 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6181  integrase, catalytic region  31.32 
 
 		 207 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218221 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6517  transposase and inactivated derivatives  30.43 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.423171  normal  0.717268 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5944  integrase, catalytic region  27.89 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656636  normal  0.0902484 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2352  Sea27  32.03 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0980283  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02324  hypothetical protein  25.34 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  26.77 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  26.77 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  26.77 
 
 		 417 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1761  Integrase catalytic region  27.17 
 
 		 407 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1565  hypothetical protein  35.87 
 
 		 93 aa  53.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109766  normal  0.0927482 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4098  Integrase catalytic region  26.79 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0312  Integrase catalytic region  25.38 
 
 		 416 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  21.69 
 
 		 497 aa  50.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  21.69 
 
 		 497 aa  50.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  21.69 
 
 		 497 aa  50.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0381  integrase catalytic subunit  20.59 
 
 		 441 aa  50.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0544  integrase catalytic subunit  20.59 
 
 		 441 aa  50.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.265235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1107  integrase catalytic subunit  20.59 
 
 		 441 aa  50.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.515553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1874  integrase catalytic subunit  20.59 
 
 		 441 aa  50.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3833  hypothetical protein  25.4 
 
 		 164 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283519  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1100  transposase  28.69 
 
 		 143 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.196499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0541  putative transposase integrase  27.41 
 
 		 379 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3643  putative transposase  27.41 
 
 		 379 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4261  putative transposase  27.41 
 
 		 379 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4349  putative transposase  27.41 
 
 		 379 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.732851  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4350  putative transposase  27.41 
 
 		 379 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0646  Integrase catalytic region  26.21 
 
 		 724 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1842  transposase  29.09 
 
 		 130 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0113266 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1712  helix-turn-helix, Fis-type  43.94 
 
 		 93 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>