9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02143 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02143  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3833  hypothetical protein  48.78 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283519  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1084  integrase catalytic region  57.58 
 
 		 494 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310886 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7305  integrase, catalytic region  57.58 
 
 		 264 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306385 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3832  integrase catalytic subunit  57.58 
 
 		 496 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322894  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6516  integrase catalytic subunit  57.58 
 
 		 496 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.983833  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1677  integrase catalytic region  57.58 
 
 		 496 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6204  integrase catalytic region  57.58 
 
 		 496 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5944  integrase, catalytic region  57.58 
 
 		 204 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656636  normal  0.0902484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>