40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6522 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6522  transposase and inactivated derivatives  100 
 
 		 90 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4300  integrase catalytic region  56.52 
 
 		 468 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1576  transposase  56.52 
 
 		 311 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230399  normal  0.02765 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1084  integrase catalytic region  54.41 
 
 		 494 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310886 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7305  integrase, catalytic region  53.62 
 
 		 264 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306385 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7317  integrase catalytic region  53.62 
 
 		 374 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.0472875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5175  Integrase catalytic region  79.49 
 
 		 477 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1677  integrase catalytic region  71.43 
 
 		 496 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6204  integrase catalytic region  71.43 
 
 		 496 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3832  integrase catalytic subunit  69.05 
 
 		 496 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322894  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6516  integrase catalytic subunit  69.05 
 
 		 496 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.983833  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3038  integrase catalytic subunit  45.24 
 
 		 417 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.158166  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4735  integrase catalytic subunit  61.9 
 
 		 464 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1989  integrase catalytic subunit  61.9 
 
 		 464 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0157211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0670  putative transposase  69.23 
 
 		 462 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0369159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4092  integrase catalytic subunit  64.1 
 
 		 431 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5238  integrase catalytic region  58.97 
 
 		 432 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2654  integrase catalytic region  58.97 
 
 		 432 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.268588 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2648  Integrase catalytic region  61.54 
 
 		 468 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2121  Integrase catalytic region  61.54 
 
 		 468 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1843  transposase  61.54 
 
 		 491 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0142418 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1286  integrase catalytic region  38.1 
 
 		 457 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.654292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4886  integrase catalytic region  38.1 
 
 		 457 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6422  integrase catalytic region  42.03 
 
 		 469 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.902721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_31  putative phage intergrase  56.41 
 
 		 445 aa  50.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3937  transposase protein, Y4bF  31.33 
 
 		 458 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5282  Integrase catalytic region  38.1 
 
 		 457 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1967  Integrase catalytic region  38.1 
 
 		 457 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227669  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2865  putative transposase  31.33 
 
 		 459 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7360  integrase catalytic subunit  31.33 
 
 		 339 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0181906  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6235  Integrase catalytic region  51.28 
 
 		 475 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782279  normal  0.38936 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6234  Integrase catalytic region  35.71 
 
 		 457 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.416646 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6382  Integrase catalytic region  35.71 
 
 		 457 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.583373 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3280  integrase catalytic subunit  30.12 
 
 		 317 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.583833  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4409  Integrase catalytic region  48.72 
 
 		 475 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1789  Integrase catalytic region  48.72 
 
 		 475 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5284  Integrase catalytic region  48.72 
 
 		 474 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1969  Integrase catalytic region  48.72 
 
 		 474 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.233913  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6205  Integrase catalytic region  48.72 
 
 		 474 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.480184 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4696  Integrase catalytic region  46.15 
 
 		 432 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.019819  normal  0.12529 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>