More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4349 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4349  transposase  100 
 
 
329 aa  669    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1107  Integrase catalytic region  70.82 
 
 
332 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.528266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1813  Integrase catalytic region  70.52 
 
 
332 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1272  integrase catalytic subunit  70.39 
 
 
329 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1255  integrase catalytic subunit  70.39 
 
 
329 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2416  integrase catalytic subunit  70.39 
 
 
329 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571149  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  57.58 
 
 
328 aa  372  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1510  integrase catalytic subunit  59.16 
 
 
325 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4847  Integrase catalytic region  55.76 
 
 
328 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1120  integrase catalytic subunit  54.33 
 
 
358 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  54.33 
 
 
358 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1068  integrase catalytic subunit  54.19 
 
 
358 aa  358  5e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1052  integrase catalytic subunit  54.19 
 
 
358 aa  358  5e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1652  integrase catalytic subunit  54.19 
 
 
358 aa  358  6e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  55.45 
 
 
481 aa  350  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4313  integrase catalytic subunit  59.24 
 
 
309 aa  350  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0419733  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22790  integrase family protein  54.09 
 
 
318 aa  338  7e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.582156  normal  0.782085 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  59.17 
 
 
422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  50.44 
 
 
330 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  50.44 
 
 
330 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  50.44 
 
 
330 aa  281  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  50 
 
 
330 aa  280  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  49.85 
 
 
347 aa  276  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0287  Integrase catalytic region  44.27 
 
 
318 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1036  Integrase catalytic region  44.27 
 
 
318 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1133  Integrase catalytic region  44.27 
 
 
318 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2591  integrase catalytic subunit  45.29 
 
 
333 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4011  integrase catalytic subunit  45.29 
 
 
333 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141418  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3793  integrase catalytic subunit  45.59 
 
 
321 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338369  normal  0.128891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2546  integrase catalytic subunit  45.29 
 
 
333 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303835  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3937  integrase catalytic subunit  45.29 
 
 
333 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3720  integrase catalytic subunit  45.29 
 
 
333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158828  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  42.99 
 
 
316 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  42.99 
 
 
316 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21500  transposase  41.81 
 
 
335 aa  230  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  42.68 
 
 
316 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3394  integrase catalytic subunit  41.05 
 
 
315 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0549  integrase catalytic subunit  41.05 
 
 
315 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  42.68 
 
 
316 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4025  integrase catalytic subunit  41.05 
 
 
315 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  42.68 
 
 
316 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3207  integrase catalytic subunit  41.05 
 
 
315 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249137  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  41.05 
 
 
315 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0179  integrase catalytic subunit  41.05 
 
 
315 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  41.05 
 
 
315 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  41.05 
 
 
315 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0485  integrase catalytic subunit  41.05 
 
 
315 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1990  integrase catalytic subunit  41.05 
 
 
315 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2560  integrase catalytic subunit  41.05 
 
 
315 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278482  decreased coverage  0.00231503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0673  integrase catalytic subunit  41.05 
 
 
315 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3424  integrase catalytic subunit  41.05 
 
 
315 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2654  integrase catalytic subunit  41.05 
 
 
315 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  0.067102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3352  integrase catalytic subunit  41.05 
 
 
315 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2137  integrase catalytic subunit  41.05 
 
 
315 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1870  integrase catalytic subunit  41.05 
 
 
315 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2979  integrase catalytic subunit  41.05 
 
 
315 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161528  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3658  integrase catalytic subunit  41.05 
 
 
315 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05300  transposase  41.52 
 
 
335 aa  226  3e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  41.25 
 
 
314 aa  225  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  41.25 
 
 
314 aa  225  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  41.25 
 
 
314 aa  225  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  41.25 
 
 
314 aa  225  9e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  41.25 
 
 
314 aa  225  9e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  41.69 
 
 
335 aa  224  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1534  integrase catalytic subunit  44.69 
 
 
341 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1511  integrase catalytic subunit  44.69 
 
 
341 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  41.43 
 
 
316 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3687  Integrase catalytic region  42.22 
 
 
351 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3283  Integrase catalytic region  42.22 
 
 
351 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0513  ISBm3, transposase, programmed frameshift  39.38 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23770  integrase family protein  43.35 
 
 
334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1334  Integrase catalytic region  42.22 
 
 
335 aa  211  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.661987  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3273  Integrase catalytic region  42.22 
 
 
335 aa  210  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0797  Integrase catalytic region  41.81 
 
 
335 aa  211  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1610  Integrase catalytic region  41.91 
 
 
335 aa  210  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03170  transposase  41.42 
 
 
320 aa  207  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11870  transposase  41.05 
 
 
365 aa  206  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0754  integrase catalytic subunit  40.13 
 
 
315 aa  205  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0489  transposase  36.95 
 
 
195 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18440  hypothetical protein  50 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0765744  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5281  histidine kinase  69.33 
 
 
151 aa  119  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.263883  normal  0.386303 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5727  histidine kinase  69.33 
 
 
151 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.21896  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  31.21 
 
 
380 aa  107  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0541  putative transposase integrase  30.06 
 
 
379 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3643  putative transposase  30.06 
 
 
379 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4261  putative transposase  30.06 
 
 
379 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4349  putative transposase  30.06 
 
 
379 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.732851  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4350  putative transposase  30.06 
 
 
379 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  29.3 
 
 
381 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  29.3 
 
 
381 aa  102  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  29.3 
 
 
381 aa  102  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  29.3 
 
 
381 aa  102  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  29.3 
 
 
381 aa  102  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  29.3 
 
 
381 aa  102  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  29.3 
 
 
381 aa  102  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7219  transposase  30.62 
 
 
369 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2890  transposase  30.62 
 
 
377 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0319653  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5108  transposase  30.62 
 
 
377 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  30.82 
 
 
338 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3594  transposase  30.62 
 
 
377 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0294035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>