More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6865 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6865  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 443 aa  904    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5757  FAD dependent oxidoreductase  80.59 
 
 		 443 aa  745    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4112  FAD dependent oxidoreductase  40.41 
 
 		 439 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09750  putative oxidoreductase  41.19 
 
 		 439 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1374  FAD dependent oxidoreductase  40.18 
 
 		 439 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2113  putative oxidoreductase protein  43.86 
 
 		 387 aa  333  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0578145  normal  0.36209 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4836  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 448 aa  292  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458657 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5280  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 		 448 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001295  glycine/D-amino acid oxidase  35.91 
 
 		 438 aa  282  7.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2818  FAD dependent oxidoreductase  39.62 
 
 		 439 aa  279  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4774  FAD dependent oxidoreductase  36.82 
 
 		 448 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.952242  normal  0.115123 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4822  FAD dependent oxidoreductase  36.59 
 
 		 448 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537727  normal  0.272998 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4751  FAD dependent oxidoreductase  35.89 
 
 		 447 aa  273  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3065  hypothetical protein  34.39 
 
 		 448 aa  269  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0139193  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4005  oxidoreductase, NAD-binding site  37.22 
 
 		 446 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0756508  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7256  oxidoreductase  34.68 
 
 		 448 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4482  FAD dependent oxidoreductase  31.89 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4199  FAD dependent oxidoreductase  31.89 
 
 		 437 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1106  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 439 aa  248  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2297  FAD dependent oxidoreductase  31.64 
 
 		 446 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5370  oxidoreductase-related protein  35.16 
 
 		 442 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.195 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2476  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 430 aa  223  6e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.326489  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 428 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 428 aa  131  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  29.78 
 
 		 426 aa  126  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 427 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  29.78 
 
 		 426 aa  126  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  29.78 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 		 427 aa  126  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  29.78 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  29.78 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  29.78 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  29.71 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 		 428 aa  124  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 457 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 		 427 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  28.64 
 
 		 468 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 430 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 427 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 427 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 427 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 428 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  26.93 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  27.4 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  28.72 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 		 437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 473 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  27.41 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 441 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  27.34 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  23.94 
 
 		 464 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 427 aa  113  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  28.35 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  27.16 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  26.21 
 
 		 465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  26.28 
 
 		 433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  28.87 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 		 435 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  28.68 
 
 		 428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 		 468 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 		 468 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 443 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 435 aa  110  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  29.77 
 
 		 437 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 427 aa  109  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  27.83 
 
 		 468 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  25.31 
 
 		 424 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 425 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>