More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6427 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6427  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.188529 
 
 
-
 
NC_003296  RS03061  hypothetical protein  84.11 
 
 
215 aa  360  9e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0804  hypothetical protein  82.33 
 
 
215 aa  357  6e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4485  hypothetical protein  82.33 
 
 
215 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.593276  normal  0.69449 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1148  hypothetical protein  81.4 
 
 
215 aa  352  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.384763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0310  hypothetical protein  79.91 
 
 
215 aa  346  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1115  hypothetical protein  79.91 
 
 
215 aa  346  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0267  hypothetical protein  79.91 
 
 
215 aa  346  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0116  hypothetical protein  79.91 
 
 
215 aa  346  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.56852  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1285  hypothetical protein  79.91 
 
 
215 aa  346  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426387  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1702  hypothetical protein  79.91 
 
 
215 aa  346  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1788  hypothetical protein  79.91 
 
 
215 aa  346  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3866  hypothetical protein  78.95 
 
 
214 aa  340  9e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4708  hypothetical protein  78.95 
 
 
214 aa  340  9e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3655  hypothetical protein  78.95 
 
 
214 aa  340  9e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0802029  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2456  hypothetical protein  78.95 
 
 
214 aa  338  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916967  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5051  hypothetical protein  79.43 
 
 
214 aa  338  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.325603 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5401  hypothetical protein  78.47 
 
 
214 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3905  hypothetical protein  77.78 
 
 
215 aa  330  9e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0618479  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3560  hypothetical protein  77.99 
 
 
214 aa  330  9e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227578  normal  0.135596 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5082  hypothetical protein  74.77 
 
 
217 aa  325  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.343747  normal  0.389351 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04090  hypothetical protein  77.03 
 
 
224 aa  322  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2266  hypothetical protein  75.73 
 
 
212 aa  312  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3239  hypothetical protein  69.27 
 
 
218 aa  309  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2103  hypothetical protein  69.71 
 
 
214 aa  301  5.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0505  hypothetical protein  64.08 
 
 
220 aa  247  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3029  hypothetical protein  59.13 
 
 
217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  37.22 
 
 
289 aa  89.4  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  32.72 
 
 
256 aa  85.5  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0819  OmpA/MotB domain protein  33.5 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.912264 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  34.15 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  35.66 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  27.36 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  35.06 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  31.95 
 
 
343 aa  82.4  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1539  motB protein, putative  33.71 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.198619  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  35.33 
 
 
375 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  33.14 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2870  OmpA/MotB domain protein  32.12 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  32.56 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  34.57 
 
 
279 aa  78.6  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  34.85 
 
 
314 aa  78.2  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  34.85 
 
 
343 aa  78.2  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  32.1 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  37.09 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  40.18 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  31.25 
 
 
305 aa  75.5  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  34.36 
 
 
799 aa  75.1  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  33.33 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  35.25 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  35 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  36.17 
 
 
463 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1013  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  28.31 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  36.8 
 
 
323 aa  72  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  39.39 
 
 
648 aa  72  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  35.06 
 
 
525 aa  71.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  35.38 
 
 
296 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  30.61 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  31.09 
 
 
458 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  31.09 
 
 
458 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  27 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  31.09 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  36.76 
 
 
784 aa  70.5  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  35.16 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  41.44 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  32.79 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  33.33 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  32.28 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  32.5 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3865  flagellar motor protein MotD  36.22 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  33.78 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  35.46 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4077  OmpA/MotB domain protein  36.28 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  33.67 
 
 
525 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  32.8 
 
 
345 aa  68.9  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  30.57 
 
 
447 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  33.67 
 
 
525 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  35.25 
 
 
286 aa  68.6  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1710  OmpA/MotB domain-containing protein  31.1 
 
 
342 aa  68.2  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.590071  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  34.65 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  29.32 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  30.77 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  28.27 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6475  OmpA/MotB domain protein  36.07 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38145  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  30.71 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  28.8 
 
 
421 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  36.97 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  28.8 
 
 
421 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  29.32 
 
 
421 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  27.08 
 
 
434 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  29.32 
 
 
421 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  34.17 
 
 
240 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3587  chemotaxis protein MotB  36.21 
 
 
242 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  33.87 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1661  OmpA/MotB domain protein  31.46 
 
 
342 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 
240 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  26.18 
 
 
432 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>