117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5879 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  100 
 
 		 115 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4015  transport-associated  70.41 
 
 		 118 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1624  putative phospholipid-binding protein  53.45 
 
 		 119 aa  103  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0267001  normal  0.292905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5031  transport-associated  51.72 
 
 		 119 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677375 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3244  transport-associated  47.06 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.688311  normal  0.631575 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4971  transport-associated  46.22 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314311  normal  0.115696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2416  transport-associated  45.16 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1419  transport-associated domain-containing protein  58.21 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2545  transport-associated protein  40.17 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.899169 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3880  putative periplasmic protein  45.3 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0885  transport-associated domain-containing protein  55.22 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3185  transport-associated domain-containing protein  55.22 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0627443  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1891  putative phospholipid-binding protein  55.22 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944608  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2029  transport-associated domain-containing protein  52.86 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.168793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3201  phospholipid-binding domain-containing protein  52.86 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2719  transport-associated domain-containing protein  52.86 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3148  putative phospholipid-binding protein  55.22 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0718  transport-associated  41.53 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523753  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0735  transport-associated  41.53 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0799  transport-associated  46.15 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  50.7 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0356  transport-associated  39.83 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29049  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0839  transport-associated  39.83 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0811  transport-associated  39.83 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2719  putative phospholipid-binding protein  41.28 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3931  transport-associated protein  39.83 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0118237 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5640  transport-associated  40.54 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3177  transport-associated  50.75 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944582  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5191  transport-associated  50.75 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5086  transport-associated  50.75 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4984  transport-associated  43.43 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0812534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3270  transport-associated  35.59 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21303  normal  0.821762 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2480  transport-associated protein  42.05 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.567161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3026  transport-associated protein  37.72 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311021  normal  0.461623 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3885  transport-associated  43.28 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.225437 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2456  transport-associated protein  38.89 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3429  transport-associated protein  37.8 
 
 		 412 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.389194  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6356  transport-associated  36.36 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.802203  normal  0.334542 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  36.52 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3042  hypothetical protein  43.28 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5023  hypothetical protein  41.89 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226696  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5837  hypothetical protein  41.89 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4342  hypothetical protein  40.28 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5898  transport-associated  36.89 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0383  phospholipid binding protein  32.32 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5938  transport-associated  35.35 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483865  normal  0.018454 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4381  transport-associated protein  34.44 
 
 		 308 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1642  putative periplasmic protein  43.08 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5211  transport-associated  37.14 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0618952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5648  transport-associated  37.14 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0978596  normal  0.176508 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1716  periplasmic phospholipid binding protein  32 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.547226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2274  transport-associated  40.68 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431584  normal  0.766565 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1600  transport-associated  40.68 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0122  transport-associated  35.16 
 
 		 200 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3925  putative phophoslipid binding protein  30.26 
 
 		 193 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.679907  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  35.71 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4115  transport-associated  35.37 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2175  osmotically inducible periplasmic protein  38.33 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.17152  normal  0.224433 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  32.76 
 
 		 205 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  43.86 
 
 		 201 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2437  CBS domain containing protein  33.77 
 
 		 628 aa  43.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000875184  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  43.86 
 
 		 201 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  43.86 
 
 		 201 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  43.86 
 
 		 201 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  43.86 
 
 		 201 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  43.86 
 
 		 201 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  43.86 
 
 		 201 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  31.43 
 
 		 307 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  43.86 
 
 		 201 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  30.99 
 
 		 223 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  41.79 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  41.79 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  31.62 
 
 		 543 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0368  transport-associated  39.68 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203179  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  29.69 
 
 		 217 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  35.71 
 
 		 216 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5303  transport-associated  33.93 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320232  normal  0.0505821 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  36.62 
 
 		 303 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3315  transport-associated  35.82 
 
 		 301 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  34.33 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  36.92 
 
 		 204 aa  42  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  34 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  36.92 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  36.92 
 
 		 204 aa  42  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  36.92 
 
 		 216 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  32.31 
 
 		 217 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1236  transport-associated protein  35.82 
 
 		 170 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4238  transport-associated protein  39.06 
 
 		 244 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.248738  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  37.31 
 
 		 303 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  37.31 
 
 		 315 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  42.11 
 
 		 201 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1844  transport-associated  36 
 
 		 235 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4223  transport-associated protein  31.17 
 
 		 178 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2102  hypothetical protein  35.94 
 
 		 193 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0778  transport-associated  35.94 
 
 		 193 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  31.25 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1119  putative phophoslipid binding protein  32.14 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000111186 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1372  transport-associated  42.31 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  34.92 
 
 		 295 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6049  transport-associated  42.31 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0480722 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>