60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5859 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5859  putative transmembrane protein  100 
 
 		 372 aa  753    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0264309  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0648  putative transmembrane protein  38.15 
 
 		 347 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  33.42 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0541  putative transmembrane protein  38.11 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0295849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  34.57 
 
 		 349 aa  151  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2451  hypothetical protein  34.25 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3936  hypothetical protein  34.79 
 
 		 346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442068  normal  0.0955478 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3429  hypothetical protein  33.97 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29476  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1835  hypothetical protein  32.66 
 
 		 356 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1882  TadE family protein  35.57 
 
 		 343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.284808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2050  hypothetical protein  35.57 
 
 		 343 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0508735  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0834  hypothetical protein  35.57 
 
 		 343 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.444868  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0327  TadE-like protein  35.57 
 
 		 343 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1671  hypothetical protein  35.57 
 
 		 343 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1894  TadE family protein  35.57 
 
 		 343 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321739  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2049  hypothetical protein  34.97 
 
 		 346 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0108461  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  31.12 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  46.43 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1038  hypothetical protein  30.99 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  50 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  48.08 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  48.08 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  48.08 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  48.39 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0802  hypothetical protein  37.14 
 
 		 175 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1496  hypothetical protein  33.33 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  46 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  44.23 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  39.13 
 
 		 424 aa  54.3  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3141  hypothetical protein  28.49 
 
 		 383 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1146  hypothetical protein  29.07 
 
 		 383 aa  53.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  30.27 
 
 		 319 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  31.48 
 
 		 417 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4701  aminoacyl-tRNA synthetase class I  31.1 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0319438  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  54.39 
 
 		 323 aa  52.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  40.68 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  40.68 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2370  hypothetical protein  40.91 
 
 		 461 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217776  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1750  hypothetical protein  27.07 
 
 		 421 aa  50.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  44.19 
 
 		 418 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2535  hypothetical protein  37.72 
 
 		 602 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1950  hypothetical protein  35.51 
 
 		 602 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000061585  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2358  hypothetical protein  50 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  44.19 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1775  hypothetical protein  34.78 
 
 		 602 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00194073  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0124  hypothetical protein  34.78 
 
 		 602 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000266977  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1771  hypothetical protein  34.78 
 
 		 602 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00140523  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1041  hypothetical protein  34.78 
 
 		 602 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1796  hypothetical protein  34.78 
 
 		 602 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00710697  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2930  hypothetical protein  26.59 
 
 		 353 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437122  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1725  hypothetical protein  28.89 
 
 		 626 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299353  hitchhiker  0.00000909946 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4668  membrane protein  32.59 
 
 		 603 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270258  decreased coverage  0.000905292 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  38.18 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2636  hypothetical protein  47.06 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4401  hypothetical protein  44.64 
 
 		 534 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  46.67 
 
 		 477 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  52.27 
 
 		 406 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2052  hypothetical protein  31.98 
 
 		 418 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2702  TadE family protein  32.48 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5624  hypothetical protein  40.68 
 
 		 359 aa  43.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.542245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>