53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1796 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1775  hypothetical protein  99.83 
 
 		 602 aa  1165    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00194073  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1283  hypothetical protein  99.82 
 
 		 568 aa  1092    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00406005  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0124  hypothetical protein  99.83 
 
 		 602 aa  1165    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000266977  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1041  hypothetical protein  99.83 
 
 		 602 aa  1165    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184089  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1950  hypothetical protein  99.67 
 
 		 602 aa  1164    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000061585  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1771  hypothetical protein  99.83 
 
 		 602 aa  1165    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00140523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1796  hypothetical protein  100 
 
 		 602 aa  1167    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00710697  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2535  hypothetical protein  91.03 
 
 		 602 aa  1021    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1725  hypothetical protein  51.84 
 
 		 626 aa  559  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299353  hitchhiker  0.00000909946 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0608  hypothetical protein  52.64 
 
 		 598 aa  504  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0969981  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2401  hypothetical protein  51.44 
 
 		 649 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.612705  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2544  hypothetical protein  51.44 
 
 		 649 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7801  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1502  hypothetical protein  51.27 
 
 		 620 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0355  hypothetical protein  51.27 
 
 		 620 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0849  hypothetical protein  51.27 
 
 		 740 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1698  hypothetical protein  51.27 
 
 		 620 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0321  hypothetical protein  51.1 
 
 		 597 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1528  membrane protein  47.85 
 
 		 603 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.721881  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1048  membrane protein  47.85 
 
 		 603 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.795857  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1504  membrane protein  48.2 
 
 		 608 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000532172 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4668  membrane protein  45.87 
 
 		 603 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270258  decreased coverage  0.000905292 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1410  membrane protein  42.3 
 
 		 621 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2791  hypothetical protein  42.42 
 
 		 595 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116145  normal  0.246235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1660  cyclic nucleotide-binding protein  41.52 
 
 		 596 aa  320  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.712845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4453  hypothetical protein  34.91 
 
 		 589 aa  299  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2319  membrane protein  33.44 
 
 		 596 aa  213  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2697  hypothetical protein  33.44 
 
 		 590 aa  212  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4365  hypothetical protein  35.22 
 
 		 552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.878571  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4255  putative transmembrane protein  35.22 
 
 		 552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.179894 
 
 
-
 
NC_003296  RS02587  hypothetical protein  40.76 
 
 		 541 aa  188  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1450  hypothetical protein  30.52 
 
 		 648 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0352344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4864  hypothetical protein  31.19 
 
 		 556 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5416  transmembrane protein  32.03 
 
 		 563 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191412  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55820  hypothetical protein  31.02 
 
 		 556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2328  membrane protein-like protein  30.92 
 
 		 717 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.548737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3661  hypothetical protein  27.9 
 
 		 575 aa  107  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2063  membrane protein-like protein  28.46 
 
 		 762 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.537203 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1635  membrane protein-like protein  28.05 
 
 		 542 aa  103  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0819881 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1343  hypothetical protein  26.31 
 
 		 571 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404143  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4372  hypothetical protein  30.59 
 
 		 678 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323753 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2155  hypothetical protein  29.5 
 
 		 603 aa  88.2  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230042  normal  0.0266885 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1102  hypothetical protein  29.3 
 
 		 542 aa  85.1  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4832  hypothetical protein  29.55 
 
 		 672 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.608231  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2134  hypothetical protein  30.71 
 
 		 543 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.243617  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1664  membrane protein-like protein  29.2 
 
 		 604 aa  75.5  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0012251  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2326  hypothetical protein  29.1 
 
 		 546 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406542  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1261  hypothetical protein  28.68 
 
 		 576 aa  67.8  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0636  hypothetical protein  28.8 
 
 		 659 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2535  hypothetical protein  27.3 
 
 		 554 aa  64.3  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0838  hypothetical protein  27.65 
 
 		 651 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3507  membrane-like protein  23.45 
 
 		 573 aa  48.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.581776  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  34.88 
 
 		 424 aa  47  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  31.69 
 
 		 323 aa  46.2  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>