76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5221 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 184 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  84.78 
 
 		 185 aa  320  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  83.15 
 
 		 184 aa  317  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  75.54 
 
 		 184 aa  285  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  75.54 
 
 		 184 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  75.54 
 
 		 184 aa  285  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  75 
 
 		 184 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  75 
 
 		 184 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  75 
 
 		 184 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  75.54 
 
 		 184 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  76.24 
 
 		 187 aa  275  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  76.24 
 
 		 193 aa  275  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  76.24 
 
 		 193 aa  275  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  76.24 
 
 		 187 aa  275  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  76.24 
 
 		 187 aa  275  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  76.24 
 
 		 187 aa  275  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  75.14 
 
 		 187 aa  270  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  75.69 
 
 		 187 aa  261  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  45.86 
 
 		 185 aa  157  9e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  40.33 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  47.59 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  55.15 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  40.72 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.33 
 
 		 181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  39.2 
 
 		 204 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  37.91 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.2 
 
 		 236 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  40.12 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  37.95 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  37.35 
 
 		 207 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  42.51 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7432  hypothetical protein  43.11 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.9 
 
 		 190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  34.34 
 
 		 217 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  31.32 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  37.69 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0484  hypothetical protein  37.42 
 
 		 192 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  29.05 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  28.49 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3269  hypothetical protein  27.65 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.62 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0712  hypothetical protein  26.26 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  28.3 
 
 		 859 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  27.7 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  28.29 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.32 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  29.32 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  29.32 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  30.07 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  32.09 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  32.09 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  32.09 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  32.81 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  22.83 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  30.05 
 
 		 217 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  27.93 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  31.19 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  28.02 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.08 
 
 		 220 aa  48.5  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  29.09 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  25.34 
 
 		 170 aa  48.5  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  26.35 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  26.56 
 
 		 200 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  27.4 
 
 		 234 aa  47.8  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  27.14 
 
 		 173 aa  47.8  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  32.11 
 
 		 229 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  25.74 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  29.79 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  25.19 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  25.19 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  25.19 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  29.37 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  26.95 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1361  carboxymuconolactone decarboxylase  25.77 
 
 		 172 aa  42.4  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  26.11 
 
 		 178 aa  41.6  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>