More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4251 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4251  major facilitator transporter  100 
 
 
447 aa  889    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6975  major facilitator superfamily MFS_1  83.41 
 
 
443 aa  733    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0212916  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25970  Major facilitator superfamily protein  76.1 
 
 
414 aa  627  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4906  major facilitator superfamily MFS_1  71.46 
 
 
440 aa  622  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.291929  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5023  major facilitator transporter  70.72 
 
 
443 aa  614  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293934  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1316  general substrate transporter  71.27 
 
 
443 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3869  major facilitator transporter  66.51 
 
 
442 aa  565  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0325086  normal  0.681862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5091  major facilitator transporter  68.88 
 
 
440 aa  536  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.792856  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1999  major facilitator transporter  49.42 
 
 
443 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0211395  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2562  major facilitator transporter  47.53 
 
 
438 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.144453  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  41.76 
 
 
445 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  41.86 
 
 
451 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3391  tartrate MFS transporter, putative  47.41 
 
 
438 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200595  normal  0.335671 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  44.95 
 
 
437 aa  361  1e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  40.53 
 
 
437 aa  359  7e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  42.11 
 
 
454 aa  358  8e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  43.31 
 
 
437 aa  358  9e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  45.81 
 
 
433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  45.81 
 
 
433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  44.02 
 
 
433 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  41.82 
 
 
441 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  42.73 
 
 
452 aa  353  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  45.61 
 
 
436 aa  352  8.999999999999999e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  41.59 
 
 
441 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  44.06 
 
 
445 aa  350  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  42.86 
 
 
436 aa  348  9e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  42.86 
 
 
436 aa  348  9e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  42.48 
 
 
436 aa  347  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  41.59 
 
 
442 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  43.36 
 
 
440 aa  345  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  44.83 
 
 
442 aa  344  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  40.65 
 
 
441 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  44.23 
 
 
444 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  41.22 
 
 
441 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  40.65 
 
 
441 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  42.12 
 
 
441 aa  343  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  40.65 
 
 
441 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6697  major facilitator transporter  41.78 
 
 
442 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335022  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  42.79 
 
 
440 aa  342  5.999999999999999e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  43.99 
 
 
444 aa  342  8e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  40.85 
 
 
434 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  42.61 
 
 
441 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  40.96 
 
 
441 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  42.61 
 
 
441 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  42.61 
 
 
441 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  45.97 
 
 
430 aa  341  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  41.02 
 
 
441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2119  major facilitator transporter  43.41 
 
 
443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0773675 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  41.35 
 
 
434 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6175  major facilitator superfamily MFS_1  43.1 
 
 
429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  41.01 
 
 
428 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  41.87 
 
 
441 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  40.78 
 
 
441 aa  339  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  41.01 
 
 
428 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  42.09 
 
 
439 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  42.12 
 
 
469 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  42.12 
 
 
440 aa  338  9e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  42.12 
 
 
440 aa  338  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  42.12 
 
 
440 aa  338  9e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  42.12 
 
 
440 aa  338  9e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  42.12 
 
 
440 aa  338  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  41.26 
 
 
442 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  42.55 
 
 
442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  40.32 
 
 
443 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  42.21 
 
 
469 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  39.91 
 
 
462 aa  337  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  41.61 
 
 
443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  42.17 
 
 
437 aa  336  5e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  40.36 
 
 
441 aa  336  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  40.87 
 
 
434 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  40.87 
 
 
434 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  45.5 
 
 
444 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  40.87 
 
 
434 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  40.83 
 
 
440 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  40.14 
 
 
441 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  41.81 
 
 
442 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  41.11 
 
 
434 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  41.59 
 
 
441 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  44.04 
 
 
442 aa  333  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.41 
 
 
439 aa  333  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  39.18 
 
 
439 aa  333  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  45.5 
 
 
444 aa  332  6e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  40.83 
 
 
442 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0200  major facilitator family transporter  41.58 
 
 
441 aa  332  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3214  major facilitator transporter  41.12 
 
 
440 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2307  major facilitator transporter  41.54 
 
 
435 aa  331  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2144  major facilitator transporter  41.19 
 
 
437 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129107 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  40.87 
 
 
434 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3940  major facilitator family transporter  42.24 
 
 
437 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.100608  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0172  major facilitator family transporter  42.76 
 
 
441 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1636  MFS transporter  42.76 
 
 
441 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0261  major facilitator superfamily permease  42.53 
 
 
441 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  41.08 
 
 
442 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1897  major facilitator transporter  42.24 
 
 
488 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134461  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  43.19 
 
 
477 aa  329  5.0000000000000004e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  41.57 
 
 
443 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2910  general substrate transporter  41.59 
 
 
436 aa  328  9e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0430  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.86 
 
 
442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723134  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3575  major facilitator transporter  41.78 
 
 
437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.314754  normal  0.535313 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5772  major facilitator superfamily MFS_1  43 
 
 
443 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.568518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>