More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3497 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3497  ABC transporter related  100 
 
 
256 aa  511  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214692  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2446  ABC transporter component  72.06 
 
 
264 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.404334  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1229  ABC transporter related  63.49 
 
 
264 aa  329  3e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.380088  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2415  ABC transporter related  57.2 
 
 
264 aa  293  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  52.44 
 
 
257 aa  269  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  53.5 
 
 
261 aa  268  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0039  ABC transporter related  53.28 
 
 
302 aa  266  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1057  ABC transporter related  53.06 
 
 
298 aa  262  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.184914  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  50.82 
 
 
265 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  52.28 
 
 
259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1961  ABC transporter related  49.79 
 
 
254 aa  253  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0669  ABC transporter related  48.36 
 
 
254 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1073  ABC transporter related  46.96 
 
 
258 aa  248  9e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  50.2 
 
 
252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  50.61 
 
 
258 aa  244  8e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  49.59 
 
 
253 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  50.21 
 
 
267 aa  230  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3016  ABC transporter related  53.53 
 
 
249 aa  229  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0467  ABC transporter related  49.79 
 
 
253 aa  218  6e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  52.29 
 
 
264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  44.9 
 
 
293 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  50.45 
 
 
295 aa  208  8e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  45.19 
 
 
268 aa  205  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  41.77 
 
 
262 aa  204  8e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  45.65 
 
 
265 aa  204  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  49.03 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  43.78 
 
 
273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  45.23 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  45.23 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  50.98 
 
 
255 aa  195  8.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1914  ABC transporter ATP-binding protein  52.75 
 
 
264 aa  194  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  46.67 
 
 
252 aa  194  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6242  ABC transporter, ATPase subunit  50.24 
 
 
304 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  44.63 
 
 
273 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 
259 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  48.54 
 
 
275 aa  193  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  43.88 
 
 
281 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  42.19 
 
 
278 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2909  ABC transporter related  49.76 
 
 
304 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2285  ABC transporter related  49.76 
 
 
304 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2900  ABC transporter related  49.76 
 
 
304 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34746  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2811  ABC transporter related  50.24 
 
 
303 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  47.12 
 
 
256 aa  192  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2949  ABC transporter related  50.24 
 
 
303 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85186  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0173  ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 
256 aa  191  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  39.17 
 
 
249 aa  191  9e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  43.39 
 
 
268 aa  191  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  45.9 
 
 
257 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  42 
 
 
278 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  42.92 
 
 
248 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  42 
 
 
278 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  42.98 
 
 
300 aa  190  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0576  methionine import ATP-binding protein MetN  46.98 
 
 
243 aa  190  2e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0404  ABC transporter related  49.27 
 
 
292 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.027511 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1016  ABC transporter-related protein  43.97 
 
 
253 aa  189  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  43.15 
 
 
258 aa  189  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  43.55 
 
 
273 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  42.8 
 
 
272 aa  189  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  43.55 
 
 
273 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0372  ABC transporter related  50.49 
 
 
261 aa  188  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1680  ABC transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 
254 aa  188  8e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  41.08 
 
 
333 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1155  ABC transporter related  53.81 
 
 
278 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  42.92 
 
 
255 aa  187  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0091  PP-loop family protein  41.23 
 
 
246 aa  186  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0135509  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  43.55 
 
 
273 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  48.34 
 
 
277 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  43.55 
 
 
273 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0071  ABC transporter-related protein  42.63 
 
 
279 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  43.55 
 
 
273 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  43.55 
 
 
273 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0492  ABC transporter related  46.05 
 
 
292 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242272  normal  0.0865243 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  45.58 
 
 
275 aa  186  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  40.95 
 
 
248 aa  186  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0374  ABC transporter, ATP-binding protein  48.29 
 
 
280 aa  185  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.453677  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0206  ABC transporter related  45.58 
 
 
296 aa  185  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  40.8 
 
 
292 aa  184  9e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1362  ABC transporter, ATP-binding protein  48.29 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.820814  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  48.02 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0231  ABC transporter system ATP-binding protein  48.29 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0065  ABC transporter, ATP-binding protein  48.29 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0432  ABC transporter, ATP-binding protein  48.29 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440743  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0613  ABC transporter system ATP-binding protein  48.29 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.686513  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3200  ABC transporter system ATP-binding protein  48.29 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4224  ABC transporter, ATPase subunit  45.58 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0451  ABC transporter, ATP-binding protein  48.29 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  42.56 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0578  ABC transporter related  42.56 
 
 
276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.206439  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03182  ABC transporter ATP-binding protein  47.83 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  42.5 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 
269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 
269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  42.74 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1638  ABC transporter, ATP-binding protein  40.47 
 
 
240 aa  183  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1434  methionine import ATP-binding protein MetN  38.11 
 
 
246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00844706  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04770  ABC transporter, ATP binding component  46.03 
 
 
266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326188  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  43.4 
 
 
272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  40.28 
 
 
260 aa  182  6e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  43.04 
 
 
286 aa  181  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  42.44 
 
 
270 aa  181  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>