107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2306 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2306  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
461 aa  946    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2403  glycosyl transferase, group 1  40.05 
 
 
828 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
846 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
1236 aa  159  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3443  hypothetical protein  29.37 
 
 
823 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0239655  normal  0.271083 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3988  glycosyltransferase  28.23 
 
 
793 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  28.2 
 
 
1247 aa  104  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0310  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.23 
 
 
643 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
1264 aa  94  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0340  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.29 
 
 
643 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0259  glycosyl transferase family protein  24.04 
 
 
643 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.71 
 
 
443 aa  90.1  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0325  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.91 
 
 
643 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347044  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0039  glycosyl transferase group 1  21.62 
 
 
399 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2576  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
406 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.731131  normal  0.452849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2777  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
406 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 
1991 aa  70.5  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0126  glycosyl transferase group 1  23.24 
 
 
699 aa  65.1  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699661  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
353 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3551  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 
371 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.185108  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
355 aa  57  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1827  hypothetical protein  62.16 
 
 
295 aa  56.6  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580816  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 
388 aa  56.6  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
703 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 
388 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
412 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  23.67 
 
 
371 aa  55.1  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3043  hypothetical protein  61.11 
 
 
297 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000591502  hitchhiker  0.0000218626 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 
387 aa  54.3  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0470  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
456 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
396 aa  53.5  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  27.04 
 
 
370 aa  53.1  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  51.06 
 
 
227 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  22.68 
 
 
345 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 
375 aa  50.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
365 aa  50.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
412 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  26.09 
 
 
385 aa  50.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  25.77 
 
 
708 aa  50.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.69 
 
 
373 aa  50.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  26.29 
 
 
379 aa  49.3  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
398 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  21.93 
 
 
346 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1826  hypothetical protein  54.05 
 
 
287 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527067  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  58.82 
 
 
751 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  58.82 
 
 
751 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
346 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  38.57 
 
 
597 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
394 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  23.26 
 
 
440 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 
419 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
443 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
374 aa  47.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4566  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
371 aa  47.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.416296  normal  0.520192 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  47.92 
 
 
668 aa  47.4  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0763  glycosyl transferase, group 1  24.54 
 
 
337 aa  47.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4417  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 
406 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0205  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 
379 aa  47  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
424 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  55.88 
 
 
2796 aa  47  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 
371 aa  46.6  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  22.78 
 
 
371 aa  46.6  0.0009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0305  hypothetical protein  23.72 
 
 
423 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 
364 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
351 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
386 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
378 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5035  hypothetical protein  54.55 
 
 
137 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5864  glycosyl transferase group 1  20.59 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  51.43 
 
 
2342 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  51.43 
 
 
2342 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  60.61 
 
 
872 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  28.65 
 
 
415 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  23.31 
 
 
361 aa  46.2  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
396 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4522  hypothetical protein  54.55 
 
 
137 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.583974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4982  hypothetical protein  54.55 
 
 
137 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633346  normal  0.27527 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  23.64 
 
 
379 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  22.83 
 
 
386 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0306  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
198 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  29.6 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  23.98 
 
 
393 aa  45.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  24.34 
 
 
371 aa  44.7  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2418  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
396 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0392541  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 
385 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1185  hypothetical protein  54.55 
 
 
138 aa  44.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682975  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  55.88 
 
 
746 aa  44.7  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  57.58 
 
 
1476 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
416 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  26.73 
 
 
372 aa  44.3  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  23.6 
 
 
412 aa  44.3  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1077  glycosyl transferase, group 1  24.84 
 
 
325 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.508973  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  50 
 
 
255 aa  44.3  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  52.94 
 
 
120 aa  44.3  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  52.94 
 
 
115 aa  44.3  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05930  glycosyltransferase  26.01 
 
 
378 aa  44.3  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289999  hitchhiker  0.000000027455 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  23.39 
 
 
366 aa  43.9  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 
414 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
381 aa  43.5  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  23.28 
 
 
387 aa  43.5  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>