More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0801 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0230  UvrD/REP helicase  65.39 
 
 		 686 aa  907    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3142  UvrD/REP helicase  64.77 
 
 		 687 aa  904    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345803  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05321  ATP-dependent DNA helicase II protein  60.71 
 
 		 710 aa  862    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2939  UvrD/REP helicase  85.62 
 
 		 720 aa  1243    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0283  UvrD/REP helicase  62.6 
 
 		 725 aa  890    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638383  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1306  ATP-dependent DNA helicase  62.34 
 
 		 702 aa  883    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0100895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0548  UvrD/REP helicase  59.55 
 
 		 745 aa  846    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254513  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0801  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 750 aa  1531    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4241  UvrD/REP helicase  61.04 
 
 		 716 aa  856    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2701  UvrD/REP helicase  63.6 
 
 		 686 aa  887    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.311884  normal  0.28531 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2745  UvrD/REP helicase  63.4 
 
 		 687 aa  887    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223218  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4129  UvrD/REP helicase  61.04 
 
 		 716 aa  856    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.188822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1045  putative DNA helicase  87.39 
 
 		 708 aa  1223    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2743  UvrD/REP helicase  63.79 
 
 		 688 aa  890    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3768  UvrD/REP helicase  63.79 
 
 		 689 aa  912    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528765  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0232  UvrD/REP helicase  65.22 
 
 		 702 aa  901    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7513  ATP-dependent DNA helicase Rep  63.29 
 
 		 686 aa  898    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.556127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0402  UvrD/REP helicase  60.71 
 
 		 712 aa  830    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5901  UvrD/REP helicase  62.32 
 
 		 689 aa  908    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0361362  normal  0.5857 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3335  UvrD/REP helicase  63.29 
 
 		 694 aa  915    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.667259 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0258  UvrD/REP helicase  64.82 
 
 		 685 aa  910    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3295  UvrD/REP helicase  65.16 
 
 		 717 aa  949    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.763792  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3457  UvrD/REP helicase  47.34 
 
 		 700 aa  615  1e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0594  UvrD/REP helicase  41.67 
 
 		 676 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  41.02 
 
 		 681 aa  422  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  36.52 
 
 		 754 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  38.45 
 
 		 745 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1808  UvrD/REP helicase  39.42 
 
 		 725 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2122  UvrD/REP helicase  39.48 
 
 		 726 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2052  UvrD/REP helicase  39.33 
 
 		 726 aa  379  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  35.96 
 
 		 655 aa  375  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  35.45 
 
 		 714 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  36.36 
 
 		 669 aa  366  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  35.46 
 
 		 648 aa  337  5e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  35.46 
 
 		 648 aa  337  5e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  36.7 
 
 		 719 aa  335  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  33.82 
 
 		 656 aa  333  9e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2469  UvrD/REP helicase  36.18 
 
 		 724 aa  331  3e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.5744  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  32.55 
 
 		 706 aa  330  7e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3571  ATP-dependent DNA helicase UvrD  34.32 
 
 		 719 aa  325  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  35.97 
 
 		 668 aa  325  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  33.43 
 
 		 742 aa  324  4e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1017  UvrD/REP helicase  33.49 
 
 		 733 aa  322  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  36.71 
 
 		 768 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0779  UvrD/REP helicase  32.65 
 
 		 630 aa  320  7e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1967  UvrD/REP helicase  34.41 
 
 		 789 aa  310  9e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  30.49 
 
 		 735 aa  302  2e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  33.47 
 
 		 737 aa  300  9e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  31.2 
 
 		 625 aa  299  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.41 
 
 		 773 aa  297  6e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.08 
 
 		 785 aa  294  4e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  32.33 
 
 		 773 aa  292  2e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.06 
 
 		 718 aa  292  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.56 
 
 		 755 aa  291  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  30.59 
 
 		 749 aa  291  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  33.18 
 
 		 789 aa  289  2e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  31.19 
 
 		 755 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  31.94 
 
 		 779 aa  287  5e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.07 
 
 		 730 aa  286  9e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  33.39 
 
 		 727 aa  286  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.07 
 
 		 730 aa  286  9e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.66 
 
 		 765 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  32.79 
 
 		 739 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.5 
 
 		 729 aa  285  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.55 
 
 		 673 aa  284  5.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  31.26 
 
 		 736 aa  283  8.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  33.62 
 
 		 787 aa  283  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.31 
 
 		 754 aa  281  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  32.28 
 
 		 722 aa  281  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  32.28 
 
 		 722 aa  281  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.28 
 
 		 741 aa  281  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.98 
 
 		 829 aa  281  4e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.28 
 
 		 742 aa  281  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  32.19 
 
 		 722 aa  280  8e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  31.97 
 
 		 722 aa  279  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  32.19 
 
 		 722 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  29.09 
 
 		 769 aa  279  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.63 
 
 		 858 aa  278  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.11 
 
 		 729 aa  279  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  34.33 
 
 		 797 aa  279  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  32.19 
 
 		 722 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  32.14 
 
 		 722 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  32.19 
 
 		 722 aa  279  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  32.19 
 
 		 722 aa  279  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.14 
 
 		 762 aa  278  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  32.12 
 
 		 743 aa  277  5e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.48 
 
 		 797 aa  277  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.17 
 
 		 732 aa  277  6e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  31.62 
 
 		 762 aa  277  6e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  34.77 
 
 		 797 aa  276  8e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  33.48 
 
 		 707 aa  276  9e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  32.75 
 
 		 783 aa  276  9e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.82 
 
 		 857 aa  276  9e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.56 
 
 		 786 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  31.85 
 
 		 720 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  30.08 
 
 		 764 aa  275  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  31.85 
 
 		 720 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  30.03 
 
 		 724 aa  274  5.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  32.31 
 
 		 727 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  34.12 
 
 		 709 aa  273  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>