More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0735 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0735  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  28.97 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  31.84 
 
 		 224 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  31.22 
 
 		 224 aa  128  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0327  DNA repair protein RadC  32.23 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000320995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  30.05 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  30.24 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  28.44 
 
 		 224 aa  122  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0385  DNA repair protein RadC  32.35 
 
 		 225 aa  121  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00103198  hitchhiker  0.000000153707 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2291  DNA repair protein RadC  29.76 
 
 		 242 aa  121  9e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0121519 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  30.24 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4157  DNA repair protein RadC  42.98 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2695  DNA repair protein RadC  34.41 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0326  DNA repair protein RadC  32.24 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  32.66 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0046  DNA repair protein RadC  30.73 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178856  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4561  DNA repair protein RadC  31.78 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000169917  hitchhiker  0.00000617306 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  29.95 
 
 		 224 aa  118  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3828  DNA repair protein RadC  29.58 
 
 		 225 aa  118  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.760529  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  27.67 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4033  DNA repair protein RadC  29.74 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3450  DNA repair protein RadC  32.14 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268052  normal  0.632907 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3773  DNA repair protein RadC  37.21 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  29.19 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2777  DNA repair protein RadC  31.55 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1254  DNA repair protein RadC  30 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  28.14 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  28.64 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3339  DNA repair protein RadC  29.79 
 
 		 224 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0155907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  32.66 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3837  DNA repair protein RadC  31.46 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00013144  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1252  DNA repair protein RadC  45.13 
 
 		 169 aa  115  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0359  DNA repair protein RadC  29.95 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3770  DNA repair protein RadC  29.95 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625851  normal  0.642753 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0948  DNA repair protein RadC  28.57 
 
 		 244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4248  DNA repair protein RadC  29.95 
 
 		 225 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1654  DNA repair protein RadC  29.2 
 
 		 237 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794365  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3481  DNA repair protein RadC  31.46 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0358  DNA repair protein RadC  30.52 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0732931  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0402  DNA repair protein RadC  30 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000130829  hitchhiker  0.000000000166485 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0528  DNA repair protein RadC  30.52 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0388  DNA repair protein RadC  30 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000131294  hitchhiker  0.0000732355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0695  DNA repair protein RadC  31.67 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.63774 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0377  DNA repair protein RadC  30 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000108999  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3597  DNA repair protein RadC  29.95 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0215962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2597  DNA repair protein RadC  34.91 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000367988  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0462  DNA repair protein RadC  31.78 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000108191  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3252  DNA repair protein RadC  31.21 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0257  DNA repair protein RadC  27.93 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  27.64 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2620  hypothetical protein  43.36 
 
 		 169 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.521517 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3538  DNA repair protein RadC  44.25 
 
 		 169 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2319  DNA repair protein RadC  43.36 
 
 		 169 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.094604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0144  DNA repair protein RadC  29.9 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00783617  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  28.29 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2301  DNA repair protein RadC  29.85 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5833  DNA repair protein RadC  27.75 
 
 		 257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  28.23 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0101  DNA repair protein RadC  29.95 
 
 		 221 aa  112  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000716823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2636  DNA repair protein RadC  43.75 
 
 		 168 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0606643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0376  DNA repair protein RadC  29.52 
 
 		 225 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000147811  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  29.41 
 
 		 224 aa  111  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  29.91 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02919  DNA repair protein RadC  28.38 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1733  DNA repair protein RadC  30.26 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.112707  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  31.25 
 
 		 227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3148  DNA repair protein RadC  25 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.886628  normal  0.925448 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4202  DNA repair protein RadC  38.46 
 
 		 164 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.21413 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1658  hypothetical protein  36.84 
 
 		 169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00985169  normal  0.385856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0818  DNA repair protein RadC  26.36 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  27.36 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4100  DNA repair protein RadC  29.06 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0607652  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0559  DNA repair protein RadC  31.25 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000678315  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  27.54 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2553  DNA repair protein RadC  32.11 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2409  DNA repair protein RadC  32.11 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1789  DNA repair protein  28.78 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.582251  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  27.54 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000015619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0794  DNA repair protein RadC  26.32 
 
 		 256 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.132133 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  27.54 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000900324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4139  DNA repair protein RadC  27.54 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000017896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  27.54 
 
 		 214 aa  108  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  27.54 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  27.54 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  27.86 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  29.05 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2442  DNA repair protein RadC  26.84 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2526  DNA repair protein RadC  26.76 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1890  DNA repair protein RadC  26.76 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2501  DNA repair protein RadC  26.76 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5194  DNA repair protein RadC  29.91 
 
 		 235 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0102732  normal  0.30357 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001836  DNA repair protein RadC  46.02 
 
 		 158 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  30.29 
 
 		 227 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5284  DNA repair protein RadC  29.91 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  27.54 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1904  DNA repair protein RadC  30 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000968261 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0363  DNA repair protein RadC  33.01 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  33.02 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1070  DNA repair protein RadC  30.81 
 
 		 272 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0324215  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>