44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0198 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0198  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 2335 aa  4700    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2847  WD40 domain-containing protein  27.9 
 
 		 357 aa  68.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  30 
 
 		 572 aa  61.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  28.18 
 
 		 567 aa  59.3  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  27.75 
 
 		 451 aa  58.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  26 
 
 		 461 aa  58.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  32.61 
 
 		 461 aa  57  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.03 
 
 		 430 aa  56.2  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  28.95 
 
 		 454 aa  54.7  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  23.16 
 
 		 429 aa  53.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  25.54 
 
 		 427 aa  53.5  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  30.66 
 
 		 441 aa  52  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  29.73 
 
 		 439 aa  51.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  27.22 
 
 		 434 aa  51.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.35 
 
 		 438 aa  50.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  30.88 
 
 		 457 aa  50.1  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  23.96 
 
 		 424 aa  49.7  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.53 
 
 		 407 aa  50.1  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  31.93 
 
 		 1042 aa  49.7  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  29.3 
 
 		 432 aa  49.7  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  26.67 
 
 		 432 aa  49.3  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  23.86 
 
 		 446 aa  48.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  26.92 
 
 		 441 aa  48.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.86 
 
 		 446 aa  48.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.86 
 
 		 446 aa  48.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  28.66 
 
 		 442 aa  48.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  25.78 
 
 		 443 aa  48.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  26.04 
 
 		 449 aa  48.9  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 446 aa  48.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  27.41 
 
 		 436 aa  47.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.66 
 
 		 407 aa  48.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.95 
 
 		 422 aa  48.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  27.95 
 
 		 422 aa  48.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  26.9 
 
 		 429 aa  47.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3729  WD40 domain protein beta Propeller  28.4 
 
 		 354 aa  47.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.135548  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  29.41 
 
 		 444 aa  47.8  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  29.41 
 
 		 444 aa  47.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  23.75 
 
 		 435 aa  47.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.61 
 
 		 444 aa  47  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  29.41 
 
 		 444 aa  47.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  26.58 
 
 		 434 aa  47  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  30.25 
 
 		 1040 aa  47  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  28.85 
 
 		 440 aa  46.6  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  27.49 
 
 		 426 aa  46.2  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>