More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3989 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3989  short chain dehydrogenase  100 
 
 
265 aa  541  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.826773  normal  0.0182099 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4098  short chain dehydrogenase  93.58 
 
 
265 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.474708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4563  short chain dehydrogenase  92.83 
 
 
265 aa  507  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00447639  hitchhiker  0.00143466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1110  short chain dehydrogenase  93.21 
 
 
265 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0177225  normal  0.229286 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5596  short chain dehydrogenase  92.45 
 
 
265 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.329102 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3663  short chain dehydrogenase  92.45 
 
 
265 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4704  short chain dehydrogenase  92.45 
 
 
265 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000843868  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1331  short chain dehydrogenase  83.02 
 
 
265 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2499  short chain dehydrogenase  83.02 
 
 
265 aa  450  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1239  short chain dehydrogenase  83.02 
 
 
265 aa  450  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0977  short chain dehydrogenase  83.02 
 
 
265 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0314  short chain dehydrogenase  83.02 
 
 
265 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0590  short chain dehydrogenase  83.02 
 
 
265 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155951  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1312  short chain dehydrogenase  83.02 
 
 
265 aa  450  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.445214  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7064  short chain dehydrogenase  82.26 
 
 
265 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0180  short chain dehydrogenase  81.04 
 
 
269 aa  441  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1496  short chain dehydrogenase  81.54 
 
 
260 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4238  short chain dehydrogenase  80.6 
 
 
268 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3688  short chain dehydrogenase  64.77 
 
 
265 aa  342  5e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.332248  normal  0.888803 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3574  short chain dehydrogenase  62.41 
 
 
267 aa  333  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11528  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0958  short chain dehydrogenase  61.74 
 
 
265 aa  328  6e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4637  short chain dehydrogenase  63.91 
 
 
269 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0597104  normal  0.0798604 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4505  short chain dehydrogenase  63.91 
 
 
269 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15196  normal  0.998314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3168  short chain dehydrogenase  61.65 
 
 
283 aa  312  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149072  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3959  short chain dehydrogenase  53.41 
 
 
264 aa  290  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0140  short chain dehydrogenase  54.09 
 
 
264 aa  278  6e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0822  short chain dehydrogenase  56.59 
 
 
262 aa  264  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00305292  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
362 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00359465  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 
259 aa  166  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
260 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.59 
 
 
251 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0610  putative short-chain dehydrogenase/reductase  33.33 
 
 
286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0678259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
262 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
288 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.67 
 
 
267 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 
254 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.288132 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0311  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
266 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4369  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.72 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.11 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.32 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.43 
 
 
261 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 
258 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.81 
 
 
261 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.92 
 
 
246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
257 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7174  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
256 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 
261 aa  126  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.197864  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.62 
 
 
255 aa  126  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.68 
 
 
260 aa  125  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
263 aa  125  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0128625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
262 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
249 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 
250 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117153  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.92 
 
 
246 aa  124  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2494  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.59 
 
 
248 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000082608  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2721  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
249 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1284  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.17 
 
 
251 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.183563 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
271 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1154  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  28.85 
 
 
253 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000294561  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
262 aa  123  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
252 aa  123  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
260 aa  123  3e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
254 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.7 
 
 
263 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
282 aa  122  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458273  normal  0.643271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
249 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1738  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.82 
 
 
264 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.82 
 
 
264 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0991  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  28.85 
 
 
253 aa  122  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.82 
 
 
264 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1875  tropinone reductase  32.05 
 
 
258 aa  122  7e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
295 aa  122  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
252 aa  122  8e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3749  short chain dehydrogenase  31.68 
 
 
254 aa  122  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 
262 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363126  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1221  ketoacyl reductase  33.46 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.432142  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.56 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1940  tropinone reductase  32.05 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.803191  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877905  normal  0.0437007 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0333473 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.3 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00435006  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1768  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  34.11 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323162  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.7 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11380  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.42 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.833794 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.06 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>