More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1517 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
342 aa  687    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  88.01 
 
 
342 aa  618  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  87.72 
 
 
342 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  87.72 
 
 
342 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  87.43 
 
 
342 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  86.59 
 
 
343 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  86.3 
 
 
343 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  76.02 
 
 
343 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  75.73 
 
 
343 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  74.56 
 
 
342 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  54.14 
 
 
342 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  41.23 
 
 
648 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  41.64 
 
 
659 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  41.11 
 
 
639 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
630 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
630 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1532  MerR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
604 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1556  MerR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
604 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1328  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
604 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0610  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
604 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0950  MerR family transcriptional regulator  90.48 
 
 
63 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
253 aa  96.3  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1664  MerR family transcriptional regulator  26.36 
 
 
225 aa  90.9  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
253 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
253 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  28.64 
 
 
253 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  28.9 
 
 
253 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  28.44 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  37.64 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  28.17 
 
 
251 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1491  regulatory protein MerR  35.5 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  39.13 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  28.92 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  38.76 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  26.03 
 
 
253 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  40.16 
 
 
129 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  43.52 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  53.62 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2080  transcriptional regulator, MerR family  31 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  hitchhiker  0.000000000732695 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  41.35 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  48.61 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  49.25 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  42.86 
 
 
278 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
154 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
134 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
377 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  35.25 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  30.56 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
154 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3106  regulator of pmrA, putative  24.88 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  37.61 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  57.14 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  49.33 
 
 
429 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  44.58 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  41.75 
 
 
272 aa  72.4  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  30 
 
 
315 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
125 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  39.45 
 
 
254 aa  72.4  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  44.58 
 
 
252 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
125 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
125 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  24.38 
 
 
255 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  25.14 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 
138 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  24.38 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  37.84 
 
 
136 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  38.3 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  44.44 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  42.5 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
136 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  34.25 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  35.25 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  38.14 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
145 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  31 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  35 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  31 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  35.54 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  39.05 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  44.29 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  43.68 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
141 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.784519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>