61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2706 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 79 aa  166  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2310  regulatory protein, FmdB family  55.84 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  52.78 
 
 		 78 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0261  hypothetical protein  43.06 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0420  hypothetical protein  47.22 
 
 		 75 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1427  FmdB family regulatory protein  48.61 
 
 		 80 aa  72.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4303  FmdB family regulatory protein  48.61 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  43.06 
 
 		 83 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4413  hypothetical protein  44.44 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.945619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5314  regulatory protein, FmdB family  44.44 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3238  hypothetical protein  38.16 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.882851  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1501  hypothetical protein  45.83 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1219  regulatory protein, FmdB family  45.83 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4703  hypothetical protein  41.67 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7750  FmdB family regulatory protein  45.83 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.572116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4252  hypothetical protein  40.28 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.79426  normal  0.685229 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  55 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  42 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0644  hypothetical protein  47.62 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0778  regulatory protein, FmdB family  45.24 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  40.43 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  44.9 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  45.24 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2275  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  32.43 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  30.86 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  44.44 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  44.44 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  46.34 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  42.86 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  33.33 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0920  FmdB family regulatory protein  34.62 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000112194  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4083  FmdB family regulatory protein  40.82 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.382844 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  47.62 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2748  cytochrome c family protein, putative  34.62 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  33.8 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  32.65 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  32.65 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2720  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 		 82 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0509  regulatory protein, FmdB family  38.78 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000024131  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1403  regulatory protein, FmdB family  42.11 
 
 		 85 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1496  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000164684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  29.73 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4378  FmdB family regulatory protein  33.33 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  0.589955 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  30.99 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4292  FmdB transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  42.86 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2576  cytochrome c family protein, putative  38.3 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00231924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  33.33 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0864  hypothetical protein  36.73 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  33.33 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4670  FmdB family regulatory protein  33.33 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0329006  normal  0.590525 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  45 
 
 		 76 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  30.56 
 
 		 85 aa  40.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  42.86 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2798  regulatory protein, FmdB family  35.71 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821801  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2573  regulatory protein, FmdB family  30.65 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135331 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4835  FmdB family regulatory protein  30.16 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0785  FmdB family regulatory protein  34.69 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0721  FmdB family regulatory protein  34.04 
 
 		 164 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.538439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0863  hypothetical protein  35.38 
 
 		 83 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>