More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1683 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  76.05 
 
 		 506 aa  714    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  64.27 
 
 		 497 aa  651    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 501 aa  992    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  39.66 
 
 		 490 aa  331  2e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  38.54 
 
 		 482 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2850  amino acid permease-associated region  63.57 
 
 		 134 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.714945 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 		 506 aa  167  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2580  amino acid permease-associated region  29.96 
 
 		 464 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  29.22 
 
 		 461 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2285  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 471 aa  144  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207466 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2659  amino acid permease family protein  26.88 
 
 		 468 aa  144  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.260834  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  29.47 
 
 		 495 aa  139  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 502 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 511 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 502 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 492 aa  124  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 		 492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  27.08 
 
 		 507 aa  118  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  26.73 
 
 		 489 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 		 475 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 		 469 aa  103  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  30.45 
 
 		 485 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 510 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2626  amino acid permease-associated region  25.29 
 
 		 521 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 510 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 510 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 483 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  26 
 
 		 491 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  25.42 
 
 		 467 aa  97.8  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 		 510 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  25.26 
 
 		 477 aa  95.9  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2756  amino acid permease-associated region  28.99 
 
 		 497 aa  95.9  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00077559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 513 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  24.74 
 
 		 449 aa  94  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3054  amino acid permease-associated region  27.19 
 
 		 506 aa  93.2  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  26.79 
 
 		 487 aa  93.2  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  25.97 
 
 		 469 aa  92.8  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  23.28 
 
 		 456 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  23.24 
 
 		 454 aa  90.5  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  26.41 
 
 		 495 aa  90.5  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  28.52 
 
 		 484 aa  90.1  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  24.5 
 
 		 516 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 		 485 aa  89.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  27.25 
 
 		 468 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  22.75 
 
 		 456 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 527 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  24.92 
 
 		 450 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 450 aa  87.8  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  27.12 
 
 		 441 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  23.34 
 
 		 449 aa  87  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  23.71 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2246  amino acid permease  24.03 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  25.97 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2293  amino acid permease  24.03 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.05629 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2192  amino acid permease  24.03 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  23.71 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2295  amino acid permease  24.03 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0751676 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2405  amino acid permease  24.03 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0506799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  23.53 
 
 		 455 aa  85.1  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  22.28 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 497 aa  85.1  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  22.34 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  23.71 
 
 		 450 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4136  amino acid permease family protein  23.67 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.210777  normal  0.0802051 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01917  predicted amino-acid transporter  23.77 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1643  amino acid permease-associated region  23.77 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.121061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2947  amino acid permease  23.77 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  hitchhiker  0.000000000177755 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2152  amino acid permease  23.77 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01903  hypothetical protein  23.77 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2305  amino acid permease  23.77 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4084  amino acid permease family protein  23.48 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  25 
 
 		 478 aa  84.3  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0078  amino acid permease-associated region  23.48 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1045  amino acid permease  23.77 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1626  amino acid permease-associated region  23.77 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1218  amino acid permease  23.77 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  22.07 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  21.73 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  22.07 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173953 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  22.07 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  29.39 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  22.07 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  24.02 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  22.07 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  22.99 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  24.3 
 
 		 509 aa  83.6  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  26.73 
 
 		 504 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  23.01 
 
 		 553 aa  82.8  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  23.04 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  23.76 
 
 		 466 aa  83.2  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  24.65 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  22.99 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  24.79 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  22.99 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  27.53 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  21.81 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  24.71 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  23.33 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>