More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1573 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1573  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  254  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0922315  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  57.14 
 
 		 104 aa  106  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7170  protein of unknown function DUF37  57.14 
 
 		 111 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536333  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2224  protein of unknown function DUF37  55.17 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0489467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2542  protein of unknown function DUF37  54.02 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.157236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2267  hypothetical protein  54.02 
 
 		 106 aa  100  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.412253 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1326  hypothetical protein  54.44 
 
 		 117 aa  100  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1039  hypothetical protein  55.7 
 
 		 123 aa  99.4  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0811786  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1073  hypothetical protein  55.7 
 
 		 123 aa  99.4  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4641  hypothetical protein  56.79 
 
 		 110 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682975  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1652  hypothetical protein  50.52 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2156  hypothetical protein  55 
 
 		 119 aa  99.4  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6322  hypothetical protein  56.04 
 
 		 101 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29696  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1654  hypothetical protein  53.33 
 
 		 114 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.341488  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2181  hypothetical protein  52.22 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.209372  normal  0.016777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3117  hypothetical protein  51.04 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0642  hypothetical protein  52 
 
 		 117 aa  94.7  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.485959  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1051  hypothetical protein  51.06 
 
 		 109 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3875  hypothetical protein  51.11 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3251  hypothetical protein  53.57 
 
 		 136 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2047  hypothetical protein  50.59 
 
 		 134 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5187  hypothetical protein  47.56 
 
 		 87 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1847  hypothetical protein  49.41 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108627  normal  0.0267383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1006  hypothetical protein  52.63 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  55.71 
 
 		 80 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2209  hypothetical protein  54.67 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.304599  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  48.53 
 
 		 214 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3459  hypothetical protein  49.35 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3758  hypothetical protein  49.35 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  48.57 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_912  hypothetical protein  51.56 
 
 		 70 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000074763  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  51.47 
 
 		 70 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  48.39 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  47.76 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  54.84 
 
 		 64 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  53.23 
 
 		 85 aa  77  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  52.24 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  47.76 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  52.17 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0003  hypothetical protein  51.47 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296608  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2267  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  48.61 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  75.5  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0311  hypothetical protein  53.52 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  41.56 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  49.28 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  46.38 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  50.77 
 
 		 69 aa  74.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  49.23 
 
 		 69 aa  74.3  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  48.48 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  54.1 
 
 		 87 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  45.57 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  50.77 
 
 		 70 aa  73.6  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  48.48 
 
 		 81 aa  73.6  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  48.48 
 
 		 81 aa  73.6  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04301  hypothetical protein  53.03 
 
 		 78 aa  73.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  49.21 
 
 		 82 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  45 
 
 		 86 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  44.93 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  49.25 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  43.53 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 69 aa  72  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  48.53 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4386  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104224 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  48.39 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0406  hypothetical protein  52.38 
 
 		 63 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04611  hypothetical protein  52.38 
 
 		 63 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  47.22 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  48.53 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1592  hypothetical protein  49.23 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21151  hypothetical protein  53.03 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  50.75 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2931  hypothetical protein  48.33 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04621  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3075  hypothetical protein  48.33 
 
 		 81 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  49.33 
 
 		 84 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  47.69 
 
 		 69 aa  70.5  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04721  hypothetical protein  50.79 
 
 		 63 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.132179  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  49.32 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  45.07 
 
 		 82 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  48.65 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  51.52 
 
 		 104 aa  70.1  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1745  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3826  hypothetical protein  47.22 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  47.69 
 
 		 71 aa  69.3  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  42.03 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  47.76 
 
 		 94 aa  70.1  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  40.85 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4136  protein of unknown function DUF37  44.26 
 
 		 69 aa  69.7  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0543126  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  52.78 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  40.85 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  42.03 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  42.03 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  49.23 
 
 		 69 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  42.03 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  46.05 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  46.38 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  42.03 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  42.03 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>