139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1503 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0250  putative alkaline phosphatase (phoD)  70.82 
 
 		 524 aa  744    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4636  putative alkaline phosphatase  62.86 
 
 		 523 aa  664    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0793302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1503  putative alkaline phosphatase (PhoD); putative signal peptide  100 
 
 		 522 aa  1066    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.337641  normal  0.661577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4157  secreted alkaline phosphatase protein  59.23 
 
 		 526 aa  602  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0120038  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2977  alkaline phosphatase  56.29 
 
 		 520 aa  556  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4480  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  54.88 
 
 		 527 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2698  twin-arginine translocation pathway signal  52.18 
 
 		 532 aa  535  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145958  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4171  twin-arginine translocation pathway signal  54.19 
 
 		 527 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0796  alkaline phosphatase  53.77 
 
 		 513 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13330  hypothetical protein  56.58 
 
 		 520 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  55.41 
 
 		 520 aa  522  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1200  hypothetical protein  56.58 
 
 		 517 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03245  alkaline phosphatase  56.24 
 
 		 523 aa  523  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0798  Alkaline phosphatase  52.35 
 
 		 539 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12170  alkaline phosphatase  54.38 
 
 		 519 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  52.35 
 
 		 539 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2182  alkaline phosphatase  50 
 
 		 526 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000857232 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2721  twin-arginine translocation pathway signal  52.42 
 
 		 516 aa  510  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334702  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4231  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  53.1 
 
 		 518 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  49.15 
 
 		 539 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1011  alkaline phosphatase  53.42 
 
 		 483 aa  483  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2583  alkaline phosphatase  51.38 
 
 		 567 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3867  alkaline phosphatase  53.16 
 
 		 519 aa  474  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2357  putative phosphatase or phosphodiesterase  49.72 
 
 		 528 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3488  alkaline phosphatase  52.03 
 
 		 520 aa  464  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1306  putative secreted alkaline phosphatase  49.8 
 
 		 573 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  49.29 
 
 		 514 aa  458  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  44.96 
 
 		 541 aa  432  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1057  alkaline phosphatase  45.51 
 
 		 546 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17510  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  45.85 
 
 		 547 aa  400  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0778784  normal  0.245984 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3035  alkaline phosphatase  42.59 
 
 		 559 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.852878 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  27.08 
 
 		 727 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0221  hypothetical protein  42.69 
 
 		 191 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  28.47 
 
 		 555 aa  130  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  28.89 
 
 		 555 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  29.18 
 
 		 538 aa  118  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  28.54 
 
 		 529 aa  114  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.9 
 
 		 524 aa  108  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  26.91 
 
 		 540 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  27.32 
 
 		 521 aa  107  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  28.64 
 
 		 523 aa  105  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  29.75 
 
 		 523 aa  105  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  26.46 
 
 		 534 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  28.12 
 
 		 531 aa  103  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  27.1 
 
 		 531 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  27.63 
 
 		 530 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  28.32 
 
 		 520 aa  99.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  27.56 
 
 		 522 aa  97.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.11 
 
 		 552 aa  97.1  8e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1582  Alkaline phosphatase  25.19 
 
 		 530 aa  96.7  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.870601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  26.27 
 
 		 524 aa  96.3  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  25.76 
 
 		 563 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  27.52 
 
 		 549 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  26.74 
 
 		 530 aa  94.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  27.79 
 
 		 545 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  27.54 
 
 		 538 aa  94.4  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  25.79 
 
 		 523 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  26.82 
 
 		 511 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5489  twin-arginine translocation pathway signal  26.29 
 
 		 670 aa  93.6  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4228  twin-arginine translocation pathway signal  26.95 
 
 		 535 aa  93.6  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.183471  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  26.37 
 
 		 564 aa  93.6  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  26.52 
 
 		 523 aa  92  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  25.76 
 
 		 587 aa  92.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  25.65 
 
 		 600 aa  92  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  26.69 
 
 		 528 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  26.13 
 
 		 541 aa  92.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  24.88 
 
 		 450 aa  92.4  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  26.99 
 
 		 541 aa  91.7  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  25.58 
 
 		 516 aa  91.3  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  27.19 
 
 		 529 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  27.01 
 
 		 523 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  27.49 
 
 		 540 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5658  Alkaline phosphatase  27.91 
 
 		 596 aa  89.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  27.39 
 
 		 519 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4022  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.36 
 
 		 573 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  26.74 
 
 		 617 aa  87.8  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  27.04 
 
 		 606 aa  87.8  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003734  putative alkaline phosphatase  23.53 
 
 		 557 aa  87  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.139476  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2613  alkaline phosphatase  26.84 
 
 		 679 aa  86.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3044  alkaline phosphatase  26.81 
 
 		 710 aa  86.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0355467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4060  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  25.12 
 
 		 573 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1243  Alkaline phosphatase  24.64 
 
 		 714 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4037  alkaline phosphatase  24.87 
 
 		 583 aa  86.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  25.21 
 
 		 538 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  25.45 
 
 		 522 aa  85.9  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  26.65 
 
 		 523 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  26.01 
 
 		 576 aa  85.5  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  26.85 
 
 		 540 aa  85.9  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5032  alkaline phosphatase  27.03 
 
 		 544 aa  84.7  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3997  Alkaline phosphatase  27.27 
 
 		 513 aa  84  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647493  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  26.15 
 
 		 525 aa  83.2  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1077  Alkaline phosphatase  27.42 
 
 		 534 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.452967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4057  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like  25.72 
 
 		 585 aa  81.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  24.44 
 
 		 529 aa  81.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  26.28 
 
 		 532 aa  81.3  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  25.79 
 
 		 582 aa  80.5  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  26.84 
 
 		 585 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  25.39 
 
 		 618 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02038  hypothetical protein  23.08 
 
 		 557 aa  79  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  24.12 
 
 		 550 aa  78.2  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>