38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15340 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  100 
 
 		 253 aa  475  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  59.46 
 
 		 107 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  56.76 
 
 		 107 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  58.11 
 
 		 107 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  44.68 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  50 
 
 		 131 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  49.37 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  47.14 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  58.62 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  30 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1899  TM2 domain-containing protein  47.06 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.47053  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23650  predicted membrane protein  41.79 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.360975 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  41.38 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  42.42 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  35.29 
 
 		 109 aa  57.4  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01500  predicted membrane protein  41.1 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2820  TM2 domain-containing protein  48.15 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03530  predicted membrane protein  43.94 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0851449 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0382  hypothetical protein  38.89 
 
 		 88 aa  53.5  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  30.52 
 
 		 2851 aa  51.2  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  41.3 
 
 		 166 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1506  TM2 domain containing protein  50 
 
 		 87 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0226  TM2  32.99 
 
 		 201 aa  48.9  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27311  hypothetical protein  41.18 
 
 		 92 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  37.93 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0900  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.04 
 
 		 787 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00172468  normal  0.0499652 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  37.63 
 
 		 161 aa  47  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11420  predicted membrane protein  45.76 
 
 		 71 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0052  hypothetical protein  42.68 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000726443  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11631  hypothetical protein  43.86 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0708972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1547  hypothetical protein  36.23 
 
 		 91 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0248034 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1541  TM2 domain containing protein  38.1 
 
 		 133 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273114  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17940  predicted membrane protein  33.33 
 
 		 344 aa  42.7  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.300515  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0836  TM2 domain-containing protein  40.54 
 
 		 79 aa  42.4  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3046  TM2 domain-containing protein  37.93 
 
 		 127 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3105  TM2 domain-containing protein  37.93 
 
 		 127 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3062  TM2 domain-containing protein  37.93 
 
 		 127 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0882033  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1837  TM2  40.48 
 
 		 148 aa  42  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.535212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>