74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3376 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3376  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 218 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3726  resolvase family site-specific recombinase  95.87 
 
 		 218 aa  425  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1517  site-specific recombinase, resolvase family  95.87 
 
 		 218 aa  425  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.114467 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3749  site-specific recombinase, resolvase family  95.87 
 
 		 218 aa  425  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3480  resolvase family site-specific recombinase  94.95 
 
 		 218 aa  421  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3445  site-specific recombinase  95.41 
 
 		 218 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3396  site-specific recombinase  95.41 
 
 		 218 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3707  site-specific recombinase, resolvase family  95.41 
 
 		 218 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000349891 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3753  resolvase family site-specific recombinase  94.95 
 
 		 218 aa  421  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3798  site-specific recombinase, resolvase family  95.41 
 
 		 218 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2343  resolvase domain-containing protein  89.91 
 
 		 218 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0795867  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1238  Resolvase domain protein  67.62 
 
 		 217 aa  298  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000100955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2120  Resolvase domain protein  63.16 
 
 		 217 aa  278  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11450  Resolvase domain protein  55.05 
 
 		 219 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000780792  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2960  DNA resolvase  26.7 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000168825  unclonable  0.00000591562 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  26.67 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2733  Resolvase domain protein  30.77 
 
 		 126 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  25.84 
 
 		 509 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  29.32 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  27.01 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  27.59 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  29.32 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  26.21 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  26.21 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  26.79 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1522  Resolvase domain protein  33 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000803569  hitchhiker  0.003356 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  28.38 
 
 		 515 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  26.79 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0190  Resolvase domain protein  26.73 
 
 		 537 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  28.15 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  30.23 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  25.5 
 
 		 546 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2896  resolvase-like protein  24.88 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  26.32 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  30.53 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  28.1 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  28.1 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  27.43 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0738  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 261 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0136169  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  26.43 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  27.15 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  27.67 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3067  resolvase  26.55 
 
 		 260 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00040652  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  24.88 
 
 		 188 aa  45.8  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1941  putative site-specific recombinase, resolvase family  26.54 
 
 		 261 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.292978  normal  0.0530197 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  27.67 
 
 		 665 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1994  resolvase  26.4 
 
 		 261 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.854383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2045  resolvase family site-specific recombinase  28.28 
 
 		 260 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  27.74 
 
 		 515 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2201  resolvase family site-specific recombinase  28.28 
 
 		 260 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2033  resolvase domain-containing protein  26.46 
 
 		 261 aa  45.1  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  27.33 
 
 		 377 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  26.97 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  26 
 
 		 641 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  29.41 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  30.91 
 
 		 475 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  29.41 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  29.41 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  28.16 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  27.1 
 
 		 515 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  26.32 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2222  putative site-specific recombinase, resolvase family  27.59 
 
 		 261 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61199e-51 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  29.45 
 
 		 541 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  30.86 
 
 		 498 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  26.03 
 
 		 613 aa  42.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  31.71 
 
 		 504 aa  42.4  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  24.84 
 
 		 494 aa  42.4  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3978  resolvase domain-containing protein  23.6 
 
 		 258 aa  42.4  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  27.1 
 
 		 537 aa  42  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  27.63 
 
 		 547 aa  42  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  25.69 
 
 		 563 aa  42  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  24.49 
 
 		 546 aa  41.6  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 208 aa  41.6  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>