More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2476 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  367  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  94.59 
 
 		 185 aa  353  8.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  94.59 
 
 		 185 aa  353  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  94.59 
 
 		 185 aa  353  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  94.05 
 
 		 185 aa  352  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  94.05 
 
 		 185 aa  351  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  94.05 
 
 		 185 aa  350  5.9999999999999994e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  94.05 
 
 		 185 aa  350  5.9999999999999994e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  93.51 
 
 		 185 aa  350  8e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  93.51 
 
 		 185 aa  350  8e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  92.97 
 
 		 185 aa  348  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  73.51 
 
 		 185 aa  286  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  69.73 
 
 		 186 aa  273  8e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  62.43 
 
 		 184 aa  236  1e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  61.33 
 
 		 184 aa  231  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  61.33 
 
 		 184 aa  231  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  58.38 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  57.46 
 
 		 186 aa  230  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  57.38 
 
 		 186 aa  228  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  58.38 
 
 		 185 aa  228  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  57.84 
 
 		 187 aa  228  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  61.11 
 
 		 184 aa  226  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  59.46 
 
 		 185 aa  225  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  58.66 
 
 		 183 aa  217  7e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  54.14 
 
 		 184 aa  216  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 184 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  56.35 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  57.22 
 
 		 184 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  55.74 
 
 		 184 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  211  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  210  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  209  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 185 aa  209  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  51.91 
 
 		 184 aa  209  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 185 aa  207  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  207  9e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  207  9e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  55.75 
 
 		 174 aa  205  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  62.01 
 
 		 184 aa  204  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  204  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  52.72 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  54.91 
 
 		 182 aa  201  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 184 aa  201  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  200  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0475  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.840836  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  51.37 
 
 		 186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0804  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144692  hitchhiker  0.0000000000784009 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  51.96 
 
 		 186 aa  198  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  53.04 
 
 		 186 aa  198  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  51.96 
 
 		 186 aa  198  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  51.96 
 
 		 186 aa  198  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  51.96 
 
 		 186 aa  198  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  51.96 
 
 		 186 aa  198  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  53.04 
 
 		 186 aa  198  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  51.96 
 
 		 186 aa  198  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  51.96 
 
 		 186 aa  198  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  56.57 
 
 		 181 aa  198  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  52.49 
 
 		 186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  52.49 
 
 		 186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  52.49 
 
 		 186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  197  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  197  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2452  ribosome recycling factor  51.4 
 
 		 186 aa  197  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26871  hitchhiker  0.00149746 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  197  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0647  ribosome recycling factor  51.91 
 
 		 186 aa  197  7e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222194  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  197  7e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  56 
 
 		 181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  51.96 
 
 		 186 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0121  ribosome recycling factor  53.71 
 
 		 184 aa  196  1.0000000000000001e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.466045  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5326  ribosome recycling factor  52.51 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105729  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1685  ribosome recycling factor  50.84 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  52.22 
 
 		 182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3110  ribosome recycling factor  53.14 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000000193761  hitchhiker  0.00426294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 192 aa  195  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0510  ribosome recycling factor  53.37 
 
 		 186 aa  195  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0317856  normal  0.376064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1674  ribosome recycling factor  52.57 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5908  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.107758  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  54.02 
 
 		 187 aa  194  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  194  6e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  51.45 
 
 		 184 aa  194  8.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  194  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  52.51 
 
 		 186 aa  194  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  51.96 
 
 		 186 aa  193  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3988  ribosome recycling factor  53.71 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1539  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1351  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717676  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  51.93 
 
 		 186 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12187  predicted protein  51.43 
 
 		 176 aa  192  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12896  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.460587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  48.63 
 
 		 225 aa  191  6e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>