More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7411 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7411  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
587 aa  1198    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5637  AMP-dependent synthetase and ligase  93.19 
 
 
600 aa  1087    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6150  AMP-dependent synthetase and ligase  88.38 
 
 
594 aa  1045    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102681  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6002  AMP-dependent synthetase and ligase  93.19 
 
 
600 aa  1087    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6493  AMP-dependent synthetase and ligase  93.02 
 
 
600 aa  1086    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.679743  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0136  AMP-binding domain-containing protein  50.54 
 
 
577 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1452  AMP-binding domain-containing protein  50.54 
 
 
577 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3166  AMP-binding domain-containing protein  49.57 
 
 
588 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0718  AMP-binding domain-containing protein  49.4 
 
 
686 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0642699  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0549  AMP-binding domain-containing protein  49.4 
 
 
588 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0531  AMP-binding domain-containing protein  49.39 
 
 
635 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.612015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2880  AMP-binding domain-containing protein  50.54 
 
 
577 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  30.45 
 
 
936 aa  280  6e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  30.45 
 
 
852 aa  280  7e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 
947 aa  267  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 
958 aa  250  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 
942 aa  248  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  31.45 
 
 
962 aa  242  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  34.42 
 
 
1035 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 
949 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 
958 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  32.76 
 
 
3231 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  32.24 
 
 
559 aa  231  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 
586 aa  229  9e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  31.75 
 
 
2791 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3965  AMP-dependent synthetase and ligase  36.84 
 
 
613 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666614  normal  0.454806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11375  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  40.25 
 
 
521 aa  228  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.763989  normal  0.42524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  31.22 
 
 
579 aa  226  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  31.78 
 
 
755 aa  225  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  37.23 
 
 
3208 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  31.27 
 
 
1753 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1929  AMP-dependent synthetase and ligase  32.2 
 
 
648 aa  221  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362101  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  31.79 
 
 
4317 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  32.55 
 
 
2820 aa  220  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  29.38 
 
 
588 aa  219  8.999999999999998e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  30.37 
 
 
576 aa  219  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  30.37 
 
 
573 aa  219  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  32.03 
 
 
4317 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  28.7 
 
 
581 aa  218  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  31.83 
 
 
1067 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1702  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  34.32 
 
 
521 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11665  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  26.78 
 
 
3718 aa  217  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1723  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  34.32 
 
 
521 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6079  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 
555 aa  217  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  hitchhiker  0.00908459 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  30.62 
 
 
608 aa  217  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1770  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  34.32 
 
 
524 aa  217  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0440023  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  28.9 
 
 
581 aa  216  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  30.85 
 
 
6403 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3404  AMP-dependent synthetase and ligase  33.17 
 
 
551 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.469336  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  28.4 
 
 
2997 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 
701 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  32.42 
 
 
609 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  30.14 
 
 
586 aa  213  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  32.76 
 
 
3235 aa  213  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  30.14 
 
 
576 aa  213  7e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  30.14 
 
 
573 aa  213  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11554  acyl-CoA synthetase  29.5 
 
 
583 aa  212  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  29.93 
 
 
563 aa  213  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  31.54 
 
 
4336 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  31.91 
 
 
4317 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 
653 aa  212  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  29.5 
 
 
576 aa  211  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4411  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  36.34 
 
 
528 aa  211  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  35.04 
 
 
1801 aa  211  4e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  32.79 
 
 
1789 aa  210  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  31.96 
 
 
4332 aa  210  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5217  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.78 
 
 
544 aa  209  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  30.71 
 
 
4317 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  30.53 
 
 
586 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2943  Acyl-CoA synthetases  31.61 
 
 
617 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  28.21 
 
 
7122 aa  208  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  31.34 
 
 
4342 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 
586 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  29.37 
 
 
839 aa  207  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2383  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  37.97 
 
 
535 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.962951  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  29.23 
 
 
595 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2342  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  37.97 
 
 
535 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2389  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  37.97 
 
 
535 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265242  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1828  AMP-dependent synthetase and ligase  26.27 
 
 
576 aa  207  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.397575  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11562  acyl-CoA synthetase  30.33 
 
 
584 aa  207  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  30.28 
 
 
592 aa  206  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.25 
 
 
562 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  30.19 
 
 
608 aa  205  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1945  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  35.77 
 
 
526 aa  205  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32420  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.39 
 
 
560 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.300153  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  27.53 
 
 
611 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  34.27 
 
 
610 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  33.9 
 
 
610 aa  203  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.25 
 
 
563 aa  203  8e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1161  saframycin Mx1 synthetase B  31.07 
 
 
617 aa  203  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  30.03 
 
 
4165 aa  203  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2789  AMP-binding domain-containing protein  31.07 
 
 
617 aa  203  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472303  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.6 
 
 
546 aa  203  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12964  acyl-CoA synthetase  30.53 
 
 
619 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  33.9 
 
 
599 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  33.9 
 
 
599 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  27.04 
 
 
3099 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  34.46 
 
 
599 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  31.08 
 
 
1776 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  36.82 
 
 
534 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.586249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>