46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7199 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  84.63 
 
 
423 aa  722    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  100 
 
 
423 aa  858    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  90.07 
 
 
423 aa  773    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  90.31 
 
 
423 aa  776    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  83.45 
 
 
423 aa  739    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  90.07 
 
 
423 aa  773    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  54.76 
 
 
418 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  55.24 
 
 
418 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  55 
 
 
418 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  44.5 
 
 
434 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2358  hypothetical protein  40.05 
 
 
437 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  39.19 
 
 
424 aa  229  8e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  35.25 
 
 
412 aa  210  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  34.13 
 
 
409 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  36.18 
 
 
414 aa  203  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2370  hypothetical protein  26.91 
 
 
461 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217776  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  28.18 
 
 
381 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.341792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2551  hypothetical protein  34.56 
 
 
533 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal  0.222615 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0657  hypothetical protein  41.54 
 
 
356 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0992013 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2015  hypothetical protein  26.15 
 
 
445 aa  56.6  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4401  hypothetical protein  24.92 
 
 
534 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0797  hypothetical protein  44.93 
 
 
349 aa  53.9  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  40.68 
 
 
319 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1496  hypothetical protein  44 
 
 
427 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4937  hypothetical protein  39.68 
 
 
440 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5859  putative transmembrane protein  47.73 
 
 
372 aa  50.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0264309  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  36.92 
 
 
455 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2930  hypothetical protein  40.38 
 
 
353 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437122  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  27.72 
 
 
456 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2084  hypothetical protein  40 
 
 
463 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.446219  normal  0.0261738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0636  hypothetical protein  42.86 
 
 
659 aa  47  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1518  hypothetical protein  25.64 
 
 
520 aa  47  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1660  cyclic nucleotide-binding protein  41.54 
 
 
596 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.712845 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0050  hypothetical protein  31.15 
 
 
389 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5903  hypothetical protein  28.75 
 
 
417 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336697  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  33.33 
 
 
666 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  28.28 
 
 
464 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1835  hypothetical protein  44.64 
 
 
356 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  24.39 
 
 
568 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0541  putative transmembrane protein  40.82 
 
 
344 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0295849  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  32.5 
 
 
483 aa  45.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2791  hypothetical protein  37.68 
 
 
595 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116145  normal  0.246235 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2636  hypothetical protein  36.36 
 
 
310 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  32.14 
 
 
435 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1750  hypothetical protein  49.02 
 
 
421 aa  43.5  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  35.62 
 
 
462 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.739447 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>