More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2426 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4679  porin  90.67 
 
 
386 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169136  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2426  outer membrane protein (porin)  100 
 
 
386 aa  771    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3684  porin  90.67 
 
 
386 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3838  porin  91.19 
 
 
386 aa  684    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6177  porin  91.71 
 
 
386 aa  683    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  70.54 
 
 
386 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  63.93 
 
 
386 aa  448  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  61.72 
 
 
386 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  61.46 
 
 
386 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  61.77 
 
 
384 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  61.77 
 
 
430 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  61.77 
 
 
384 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  61.46 
 
 
386 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  61.77 
 
 
411 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  61.72 
 
 
386 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  61.77 
 
 
384 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  61.77 
 
 
430 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  61.77 
 
 
384 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  61.72 
 
 
386 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  62.91 
 
 
385 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  60.94 
 
 
386 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  59.67 
 
 
386 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  59.56 
 
 
523 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  61.26 
 
 
385 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  61.26 
 
 
385 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  60.27 
 
 
393 aa  418  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  60.53 
 
 
393 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  59.95 
 
 
388 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  56.5 
 
 
394 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  60.99 
 
 
385 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  60.99 
 
 
385 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  60.71 
 
 
385 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  56.44 
 
 
390 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  56.69 
 
 
404 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  55.01 
 
 
387 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  52.54 
 
 
390 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  53.53 
 
 
390 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  52.28 
 
 
390 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  53.53 
 
 
390 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  53.76 
 
 
390 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  53.26 
 
 
390 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  53.26 
 
 
390 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  50.13 
 
 
430 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  50.9 
 
 
430 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  50.9 
 
 
430 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  50.26 
 
 
390 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  50.26 
 
 
430 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  50.26 
 
 
430 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  50.26 
 
 
430 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  49.18 
 
 
376 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  45.66 
 
 
389 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  46.79 
 
 
376 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  46.79 
 
 
376 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  46.53 
 
 
376 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  44.3 
 
 
389 aa  279  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  44.09 
 
 
385 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  43.83 
 
 
385 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  42.53 
 
 
397 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  42.53 
 
 
421 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  42.53 
 
 
421 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  40.99 
 
 
399 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  40.99 
 
 
399 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  40.99 
 
 
399 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  40.99 
 
 
399 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  42.52 
 
 
397 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  43.33 
 
 
397 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  43.24 
 
 
445 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  40.99 
 
 
399 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  41.31 
 
 
391 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  42.52 
 
 
397 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  44.36 
 
 
436 aa  259  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  43 
 
 
383 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  44.36 
 
 
436 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  44.36 
 
 
386 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  44.36 
 
 
386 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  44.36 
 
 
386 aa  258  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  44.36 
 
 
386 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  44.36 
 
 
386 aa  258  9e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  42.49 
 
 
383 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  42.49 
 
 
383 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  44.09 
 
 
386 aa  255  7e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  42.26 
 
 
383 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  42.13 
 
 
389 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  40.05 
 
 
397 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  41.16 
 
 
389 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  41.76 
 
 
389 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  43.47 
 
 
378 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5188  porin  40.65 
 
 
381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4160  porin  39.95 
 
 
405 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.396932  normal  0.277302 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6447  porin  40.72 
 
 
366 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  39.55 
 
 
391 aa  229  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5582  porin  40.52 
 
 
388 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5946  porin  40.52 
 
 
388 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  40.62 
 
 
395 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  41.44 
 
 
394 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  40.62 
 
 
395 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  40.2 
 
 
394 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3687  porin  39.71 
 
 
405 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413134  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  40.92 
 
 
402 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  39.05 
 
 
393 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>