More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2327 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2327  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3663  LysR family transcriptional regulator  95.61 
 
 		 296 aa  564  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.148857  normal  0.207098 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4959  LysR family transcriptional regulator  93.92 
 
 		 298 aa  555  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3771  LysR family transcriptional regulator  96.61 
 
 		 296 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  0.377047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3752  LysR family transcriptional regulator  96.61 
 
 		 296 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4592  LysR family transcriptional regulator  96.61 
 
 		 296 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5500  LysR family transcriptional regulator  95.61 
 
 		 296 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0486  transcriptional regulator CatR  85.67 
 
 		 295 aa  501  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1376  cat operon transcriptional activator CatR  85.96 
 
 		 295 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.345874  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0201  transcriptional regulator CatR  85.96 
 
 		 295 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2709  cat operon transcriptional activator CatR  85.96 
 
 		 295 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0985  transcriptional regulator CatR  85.96 
 
 		 295 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460056  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0232  cat operon transcriptional activator CatR  85.62 
 
 		 295 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.691367  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1573  cat operon transcriptional activator CatR  85.62 
 
 		 295 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2565  cat operon transcriptional activator CatR  85.96 
 
 		 295 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2107  LysR family transcriptional regulator  78.08 
 
 		 295 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2154  transcriptional regulator, LysR family  78.42 
 
 		 295 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4030  LysR family transcriptional regulator  74.66 
 
 		 296 aa  434  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.3967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  56.94 
 
 		 305 aa  317  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1360  transcriptional regulator, LysR family  56.6 
 
 		 303 aa  316  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325341  normal  0.0430016 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2114  LysR family transcriptional regulator  57.19 
 
 		 313 aa  316  4e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28902  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 326 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 326 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 326 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  56.25 
 
 		 303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4401  LysR family transcriptional regulator  56.88 
 
 		 305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 305 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  57.91 
 
 		 306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 305 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  57.5 
 
 		 306 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  57.71 
 
 		 306 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  57.5 
 
 		 306 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  57.5 
 
 		 306 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  57.5 
 
 		 306 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0188  transcriptional regulator CatR  57.5 
 
 		 304 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0666967  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0999  transcriptional regulator CatR  57.35 
 
 		 304 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0916  LysR family transcriptional regulator  53.58 
 
 		 305 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  55.04 
 
 		 307 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3244  LysR family transcriptional regulator  55.4 
 
 		 316 aa  300  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634923  normal  0.10907 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4880  LysR family transcriptional regulator  55.76 
 
 		 305 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.839587  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1589  transcriptional regulator, LysR family  55.4 
 
 		 307 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1131  LysR family transcriptional regulator  51.03 
 
 		 310 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0974  LysR family transcriptional regulator  52.74 
 
 		 299 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0537  LysR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 303 aa  272  5.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3827  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 304 aa  261  8.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.645077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1323  LysR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 302 aa  258  8e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0574194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2633  LysR family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 305 aa  258  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.787388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1173  LysR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 319 aa  255  8e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32200  transcriptional regulator CatR  50.36 
 
 		 290 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 305 aa  249  5e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4879  LysR family transcriptional regulator  49.27 
 
 		 291 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2728  transcriptional regulator CatR  49.27 
 
 		 290 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  48.26 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2052  LysR family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251194  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3716  LysR family transcriptional regulator  49.27 
 
 		 290 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.294124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2203  LysR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 290 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2367  transcriptional regulator, LysR family  52.73 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 301 aa  229  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08760  Transcriptional regulator, LysR family  45.99 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.139187  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  39.12 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  42.34 
 
 		 296 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  41.97 
 
 		 296 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 302 aa  185  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.59 
 
 		 300 aa  185  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  37.83 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  41.52 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1108  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.102258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.79 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1313  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 341 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000621922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1196  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 320 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5111  transcriptional regulator, LysR family  39.79 
 
 		 297 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  40.41 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 323 aa  176  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 305 aa  175  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 301 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 298 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 296 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  35.25 
 
 		 301 aa  171  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 300 aa  172  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  35.25 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0544  transcriptional regulator, LysR family  44.23 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1027  LysR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174873 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>