More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2003 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4363  FAD dependent oxidoreductase  88.54 
 
 
471 aa  868    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3750  FAD dependent oxidoreductase  66.96 
 
 
479 aa  638    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2019  FAD dependent oxidoreductase  66.96 
 
 
473 aa  636    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6224  FAD dependent oxidoreductase  83.44 
 
 
473 aa  808    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2003  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
471 aa  971    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0685  putative taurine dehydrogenase, large subunit  86.65 
 
 
472 aa  847    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4526  FAD dependent oxidoreductase  93.84 
 
 
469 aa  916    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.719592  normal  0.292372 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0118  FAD dependent oxidoreductase  66.89 
 
 
464 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  66 
 
 
464 aa  614  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4759  FAD dependent oxidoreductase  68.01 
 
 
462 aa  598  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3503  FAD dependent oxidoreductase  63.78 
 
 
466 aa  597  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3850  FAD dependent oxidoreductase  61.74 
 
 
482 aa  597  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1829  putative FAD-dependent oxidoreductase  61.11 
 
 
464 aa  592  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.226522  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4863  FAD dependent oxidoreductase  62 
 
 
466 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4289  FAD dependent oxidoreductase  60 
 
 
499 aa  569  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0106855  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1643  FAD dependent oxidoreductase  59.96 
 
 
463 aa  531  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4012  FAD dependent oxidoreductase  59.87 
 
 
462 aa  511  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  46.26 
 
 
454 aa  401  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  39.72 
 
 
446 aa  312  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2458  FAD dependent oxidoreductase  40.64 
 
 
442 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  38.36 
 
 
443 aa  294  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  38.76 
 
 
447 aa  292  8e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3398  FAD dependent oxidoreductase  39.41 
 
 
442 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0489  FAD dependent oxidoreductase  38.44 
 
 
446 aa  287  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01621  putative oxidoreductase  37.28 
 
 
452 aa  268  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0954  FAD dependent oxidoreductase  37.26 
 
 
445 aa  213  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650756  normal  0.921941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.85 
 
 
426 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 
435 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.73 
 
 
426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 
426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.85 
 
 
426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.85 
 
 
426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  32.85 
 
 
426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 
426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  32.32 
 
 
424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  32.85 
 
 
426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.85 
 
 
426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 
424 aa  172  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  34.11 
 
 
432 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 
425 aa  170  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  33.83 
 
 
428 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 
427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 
427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 
424 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  31.64 
 
 
425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 
423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 
428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 
428 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 
428 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 
444 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 
428 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  32.48 
 
 
426 aa  164  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  32.45 
 
 
427 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 
424 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 
444 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 
440 aa  163  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 
437 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 
428 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 
435 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  31.96 
 
 
444 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 
425 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 
430 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  32.99 
 
 
434 aa  160  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 
433 aa  160  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 
433 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  33.66 
 
 
427 aa  159  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 
428 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 
428 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  31.67 
 
 
425 aa  159  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 
428 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 
427 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  30.85 
 
 
435 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 
435 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 
428 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 
435 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 
428 aa  158  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 
435 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 
436 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 
433 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 
433 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  30.92 
 
 
435 aa  157  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 
425 aa  156  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 
435 aa  157  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  32.01 
 
 
428 aa  156  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2980  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 
435 aa  156  8e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104228  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 
435 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 
435 aa  156  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  32.08 
 
 
427 aa  156  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  33.25 
 
 
438 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  32.24 
 
 
427 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 
436 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 
435 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  29.81 
 
 
437 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 
435 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 
427 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 
430 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  31.16 
 
 
427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  30.81 
 
 
430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 
428 aa  154  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  30.75 
 
 
428 aa  154  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>