More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2621 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
318 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  99.69 
 
 
318 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  99.69 
 
 
318 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  95.6 
 
 
318 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2645  ribokinase-like domain-containing protein  94.34 
 
 
319 aa  587  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2513  ribokinase-like domain-containing protein  93.4 
 
 
319 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  92.74 
 
 
319 aa  580  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  77.36 
 
 
318 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0869  PfkB family kinase  77.99 
 
 
318 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0331  carbohydrate kinase  77.67 
 
 
318 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0561614  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1032  carbohydrate kinase  77.99 
 
 
318 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0629  carbohydrate kinase  77.67 
 
 
318 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0077  carbohydrate kinase  77.67 
 
 
318 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2463  carbohydrate kinase  77.67 
 
 
318 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0873  PfkB family kinase  77.36 
 
 
318 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0693  carbohydrate kinase  76.01 
 
 
271 aa  378  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0639  PfkB  55.06 
 
 
323 aa  289  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  43.99 
 
 
320 aa  271  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  41.85 
 
 
314 aa  253  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3639  kinase, pfkB family  41.77 
 
 
318 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000277248  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3416  ribokinase-like domain-containing protein  44.84 
 
 
311 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155618  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  44.41 
 
 
322 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  39.16 
 
 
310 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  45.69 
 
 
313 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  42.22 
 
 
315 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  46.18 
 
 
313 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  43.73 
 
 
313 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2482  ribokinase-like domain-containing protein  44.81 
 
 
349 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  39.03 
 
 
318 aa  219  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  40.33 
 
 
317 aa  215  8e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  41.82 
 
 
320 aa  214  9.999999999999999e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  36.6 
 
 
299 aa  215  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0290  PfkB domain protein  43.04 
 
 
325 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0261  PfkB domain protein  43.04 
 
 
325 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3586  tagatose-6-phosphate kinase  43.77 
 
 
326 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00711887  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  34.04 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  33.43 
 
 
322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  30.77 
 
 
323 aa  122  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  32.74 
 
 
317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  34.57 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  27.54 
 
 
322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  32.35 
 
 
308 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  30.57 
 
 
317 aa  108  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
308 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  33.7 
 
 
308 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  33.7 
 
 
308 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  33.58 
 
 
308 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  33.7 
 
 
308 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  33.58 
 
 
308 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  33.7 
 
 
309 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  33.7 
 
 
308 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  32.83 
 
 
312 aa  105  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  29.56 
 
 
355 aa  105  9e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  32.36 
 
 
307 aa  105  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  32.85 
 
 
308 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  28.8 
 
 
321 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  31.5 
 
 
304 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  35.56 
 
 
316 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  31.58 
 
 
322 aa  103  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  25.16 
 
 
315 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  36.03 
 
 
316 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  27.44 
 
 
323 aa  102  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  30.94 
 
 
305 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  34.08 
 
 
316 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  34.92 
 
 
316 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  31.99 
 
 
316 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  32.72 
 
 
311 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  31.63 
 
 
345 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  30.42 
 
 
323 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  33.03 
 
 
320 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  33.09 
 
 
316 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  26.91 
 
 
306 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  30.77 
 
 
304 aa  99  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  29.28 
 
 
319 aa  99  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  24.84 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  27.44 
 
 
337 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  28.43 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  26.21 
 
 
307 aa  98.2  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  31.47 
 
 
347 aa  97.4  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  33.82 
 
 
308 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  33.82 
 
 
308 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  30.11 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  30.11 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  33.82 
 
 
308 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  33.82 
 
 
308 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  33.77 
 
 
309 aa  96.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  28.91 
 
 
646 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  24.37 
 
 
313 aa  95.9  7e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  26.73 
 
 
307 aa  95.9  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  28.47 
 
 
307 aa  95.9  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0561  carbohydrate kinase  29.41 
 
 
343 aa  96.3  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  33.12 
 
 
330 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  33.12 
 
 
330 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  32.39 
 
 
330 aa  95.9  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  30.28 
 
 
311 aa  95.9  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  28.71 
 
 
319 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  32.52 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  29.04 
 
 
311 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  31.07 
 
 
314 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  32.51 
 
 
320 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>