58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0293 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_0293  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 260 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0777  ABC-2 type transporter  92.94 
 
 		 275 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1151  ABC-2 type transporter  58.04 
 
 		 263 aa  304  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0503322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3252  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  50.38 
 
 		 260 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.353542  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3287  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  50.38 
 
 		 260 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2183  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  50.38 
 
 		 260 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1076  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  50.38 
 
 		 260 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.424503  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2305  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  50.38 
 
 		 260 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917142  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3299  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  50.38 
 
 		 260 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1523  ABC-2 type transporter  49.02 
 
 		 271 aa  267  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1336  ctrC protein  50.2 
 
 		 264 aa  262  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0523  capsular polysaccharide export inner-membrane protein  52.05 
 
 		 219 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147938  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0747  hypothetical protein  47.06 
 
 		 267 aa  239  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0746  ABC-2 type transporter  44.88 
 
 		 266 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3868  hypothetical protein  41.5 
 
 		 253 aa  205  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1506  ABC-2 type transporter  41.73 
 
 		 262 aa  204  8e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2345  ABC-2 type transporter  42.21 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2575  ABC-2 type transporter  39.08 
 
 		 377 aa  192  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2962  capsule polysaccharide exporter, inner-membrane protein CtrC  39.08 
 
 		 281 aa  192  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.619605  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0721  hypothetical protein  34.51 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0661  ABC-2 type transporter  34.13 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.0551935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2083  ABC-2 type transporter  32.52 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4015  ABC-2 type transporter  31.92 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5955  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001784  capsular polysaccharide ABC transporter permease protein KpsM  24.12 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4994  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0111539 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4086  ABC-2 type transporter  24.59 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0164855  normal  0.276113 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3917  ABC polysaccharide export transporter, inner membrane subunit  24.59 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4148  ABC-2 type transporter  24.48 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424002 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3902  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0624  kpsM protein  26.51 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0290  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  24 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2125  ABC-2 type transporter  23.42 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5039  ABC-2 type transporter  23.42 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1306  ABC 2 transport system integral membrane protein  26.21 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1205  ABC-2 type transporter  24.63 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.964926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5732  polysialic acid transport protein KpsM  28.44 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1654  ABC-2 type transporter  22.91 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02828  Polysialic acid transport protein kpsM  25.1 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02777  hypothetical protein  25.1 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000408892  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5003  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501886  decreased coverage  0.000172705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3810  ABC-2 type transporter  23.32 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2581  ABC-2 type transporter  21.74 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.817053  unclonable  0.0000138463 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1782  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  23.48 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1621  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  25.53 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1441  capsular polysaccharide ABC transporter, permease protein  25.53 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6193  ABC-2 type transporter  27.22 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4941  hypothetical protein  23.58 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3235  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsM  23.55 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586026  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3810  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.7 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03059  KpsM protein  24.42 
 
 		 259 aa  46.2  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3996  hypothetical protein  21.68 
 
 		 265 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.106596  normal  0.688861 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2736  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 		 268 aa  45.4  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.13 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.89 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.7 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>