105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6859 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6859  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
131 aa  262  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643706  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0077  hypothetical protein  67.41 
 
 
135 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1101  hypothetical protein  67.41 
 
 
135 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0229521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1441  hypothetical protein  67.41 
 
 
135 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  67.41 
 
 
135 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1452  hypothetical protein  67.41 
 
 
135 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  67.41 
 
 
135 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2737  hypothetical protein  67.41 
 
 
135 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0586218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2889  hypothetical protein  67.41 
 
 
135 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3089  hypothetical protein  67.41 
 
 
135 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000589591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3142  hypothetical protein  67.41 
 
 
135 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2813  transposase  61.83 
 
 
131 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1178  putative DNA-binding protein  64.12 
 
 
131 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  36.13 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  41.22 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  36.97 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  36.97 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  36.97 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  36.97 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  36.97 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  36.97 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  36.97 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  36.97 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  36.97 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  36.97 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  36.97 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  36.97 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  36.97 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  36.97 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  36.97 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6443  transposase IS3/IS911 family protein  29.37 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000408557 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  30.58 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  36.28 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0472  putative transposase IS3/IS911  37.38 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5562  transposase IS3/IS911 family protein  39.66 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456649 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  38.1 
 
 
115 aa  58.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  37.11 
 
 
154 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  32.52 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  31.58 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1391  IS66 family element, orf1  32.2 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  29.03 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  37.11 
 
 
225 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  37.11 
 
 
225 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  37.11 
 
 
225 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  37.11 
 
 
225 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  37.11 
 
 
225 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  37.11 
 
 
225 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1337  transposase OrfA, ISEc8  33.05 
 
 
120 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  37.11 
 
 
113 aa  54.7  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  33.33 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3137  IS66 family transposase orfA  26.77 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  31.9 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2121  IS66 family orf1  27.56 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.715021  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  36.9 
 
 
170 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  39.34 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  39.34 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  39.34 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  39.34 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  29.49 
 
 
130 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  31.97 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  31.97 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0183  IS3/IS911 family transposase  29.17 
 
 
140 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1225  IS3/IS911 family transposase  29.17 
 
 
123 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.54899  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  32.14 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  31.46 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  32.14 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4707  transposase IS3/IS911 family protein  46.81 
 
 
130 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15139  normal  0.0855064 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  36.36 
 
 
224 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2977  transposase IS3/IS911 family protein  32.95 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2667  transposase IS3/IS911 family protein  32.95 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0835  transposase IS3/IS911 family protein  32.95 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.333335 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 
159 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1168  transposase IS3/IS911 family protein  32.95 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.375824  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6372  transposase ISRme19  35.24 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092485 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  73.08 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  59.38 
 
 
172 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  31.37 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  31.37 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  31.37 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  34.44 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0034  transposase  29.81 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6523  transposase IS3/IS911 family protein  27.56 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0816552  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3167  hypothetical protein  43.14 
 
 
76 aa  42  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  37.88 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  43.18 
 
 
159 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 
135 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1410  transposase IS3/IS911 family protein  35.44 
 
 
147 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3090  transposase IS3/IS911 family protein  35.44 
 
 
147 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234179  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 
110 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4652  transposase IS3/IS911 family protein  30.7 
 
 
135 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.110926  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  45.71 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0712  transposase IS3/IS911 family protein  62.96 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  32.69 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2291  transposase IS3/IS911 family protein  39.06 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112265  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  53.33 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  51.61 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>