More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3315 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
412 aa  811    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  50.26 
 
 
388 aa  345  6e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  37.47 
 
 
366 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  39.39 
 
 
359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  43.33 
 
 
349 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  33.24 
 
 
350 aa  216  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  35.16 
 
 
360 aa  206  5e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  35.16 
 
 
360 aa  206  5e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  34.79 
 
 
359 aa  201  3e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  35.1 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  32.61 
 
 
357 aa  197  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  35.34 
 
 
347 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  36.26 
 
 
387 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  35.52 
 
 
357 aa  188  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  34.83 
 
 
344 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  33.42 
 
 
358 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  33.9 
 
 
331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  34.62 
 
 
337 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  36.58 
 
 
377 aa  176  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  31.1 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2202  oxidoreductase domain-containing protein  40.93 
 
 
356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336452  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  32.2 
 
 
356 aa  171  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 
334 aa  171  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  31.2 
 
 
326 aa  168  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  34.04 
 
 
350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  34.62 
 
 
353 aa  166  8e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  35.22 
 
 
371 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  31.32 
 
 
353 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  33.14 
 
 
335 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  28.37 
 
 
383 aa  149  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 
355 aa  143  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  31.95 
 
 
375 aa  143  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  32.15 
 
 
352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  27.96 
 
 
370 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 
356 aa  139  7.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 
361 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  35.16 
 
 
387 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  26.58 
 
 
363 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  34.86 
 
 
349 aa  137  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  31.09 
 
 
391 aa  137  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  36.16 
 
 
333 aa  136  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  36.59 
 
 
341 aa  136  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  33.33 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  31.04 
 
 
388 aa  134  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  28.38 
 
 
342 aa  133  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  28.69 
 
 
383 aa  133  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  34.23 
 
 
373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  32.89 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  35.95 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  33.7 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  31.3 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  31.82 
 
 
343 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0785  oxidoreductase domain protein  29.34 
 
 
388 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 
341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 
389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  32.64 
 
 
385 aa  127  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  30.48 
 
 
341 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  28.65 
 
 
369 aa  126  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1048  oxidoreductase domain-containing protein  26.46 
 
 
376 aa  123  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.448338  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  32.28 
 
 
353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  36.07 
 
 
361 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  30.81 
 
 
356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5886  hypothetical protein  34.69 
 
 
360 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  29.77 
 
 
367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  27.08 
 
 
359 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22450  predicted dehydrogenase  26.51 
 
 
390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  35.27 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  26.33 
 
 
349 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  31.38 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  27.61 
 
 
338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  28.68 
 
 
354 aa  109  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  31.96 
 
 
357 aa  109  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 
365 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 
364 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  29.89 
 
 
358 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30.14 
 
 
353 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.68 
 
 
347 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.94 
 
 
362 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  32.59 
 
 
350 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
355 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  27.56 
 
 
357 aa  104  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  30.26 
 
 
359 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 
364 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  31.96 
 
 
346 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  31.56 
 
 
357 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  33.08 
 
 
351 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  29.09 
 
 
350 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  26.23 
 
 
334 aa  101  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 
365 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  28.81 
 
 
350 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  29.58 
 
 
334 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  29.93 
 
 
358 aa  99.4  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  27.9 
 
 
350 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  31.11 
 
 
340 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  33.09 
 
 
349 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  30.23 
 
 
367 aa  97.1  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  27.55 
 
 
344 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 
321 aa  96.7  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  28 
 
 
366 aa  96.3  8e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>