More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0363 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0363  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 235 aa  451  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2504  two component LuxR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00866313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0084  two component LuxR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6197  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.376562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2280  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.92337  normal  0.457915 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0681  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.76 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7225  two component LuxR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0340  two component LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0115466 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1460  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.659068  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2928  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.97 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012449  hitchhiker  0.0000084288 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0244  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6700  two component LuxR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2092  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0203  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.14 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5809  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 57 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.37  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1653  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6494  two component LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0149487  normal  0.504125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2757  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.28 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0593961  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  38.81 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2300  response regulator receiver protein  46.88 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1917  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2506  response regulator receiver protein  43.08 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189025  normal  0.663488 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0318  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.76 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.172489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  37.63 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0263  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103764 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2073  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 226 aa  52  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000764485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0601  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 215 aa  52  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0992  regulatory protein, LuxR  43.94 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850793  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0320  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.97 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.308686  normal  0.0930841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5645  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0608  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.89 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0353  two component LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  37.29 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0330  LuxR response regulator receiver  37.88 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673991  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2699  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000630711  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4455  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0138  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.06 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.84841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4416  response regulator receiver protein  42.42 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0551  LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 76 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 881 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2341  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7246  two component LuxR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 215 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 881 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 876 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0212  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.95 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4738  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3717  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.82478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1910  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.06 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8722  response regulator receiver protein  50 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11890  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.2 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.33 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0220  response regulator receiver protein  46.88 
 
 		 241 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 212 aa  49.3  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 217 aa  48.9  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2563  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 229 aa  48.9  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3762  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 221 aa  48.9  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.355338  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9330  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 221 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2250  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 217 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137071 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.65 
 
 		 925 aa  48.5  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3545  LuxR family two component transcriptional regulator  36.78 
 
 		 213 aa  48.9  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.701363 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1746  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139209  normal  0.0305301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0636  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.583432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 229 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  46.94 
 
 		 227 aa  48.5  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35890  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.08 
 
 		 239 aa  48.5  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.479689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2003  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 219 aa  48.5  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183245  hitchhiker  0.00373502 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.46 
 
 		 222 aa  48.5  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.53 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.740026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 799 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.44 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4661  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.59 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0948  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.28 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  46.3 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0198  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  45.28 
 
 		 893 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3305  LuxR family DNA-binding response regulator  40.32 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3517  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2524  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0516799  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3103  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.000316121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3199  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4729  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3915  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.0598624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4725  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.14 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  41.33 
 
 		 1052 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>