130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6243 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6243  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0311  hypothetical protein  46.27 
 
 		 274 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.968362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0663  hypothetical protein  45.59 
 
 		 318 aa  229  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0812  protein of unknown function DUF88  45.59 
 
 		 318 aa  229  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0673  protein of unknown function DUF88  43.3 
 
 		 165 aa  74.7  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.696503  normal  0.0525429 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0511  hypothetical protein  31.71 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  31.33 
 
 		 189 aa  72  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000124155  unclonable  0.0000000364355 
 
 
 
NC_008686  Pden_1403  hypothetical protein  33.54 
 
 		 183 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2579  hypothetical protein  31.1 
 
 		 190 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308857 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1667  hypothetical protein  31.1 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225518  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0300  hypothetical protein  31.1 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.793071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2447  hypothetical protein  29.76 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.728429 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3179  protein of unknown function DUF88  39.62 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.488088  normal  0.175977 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  31.33 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1000  protein of unknown function DUF88  28.99 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1440  hypothetical protein  30.06 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1859  hypothetical protein  31.1 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00561567  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1893  hypothetical protein  32.09 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569824  hitchhiker  0.00176101 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0991  protein of unknown function DUF88  37.36 
 
 		 195 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.727303  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0675  hypothetical protein  38.46 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1144  protein of unknown function DUF88  37.36 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2865  hypothetical protein  38.71 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414585  normal  0.0571664 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3517  protein of unknown function DUF88  27.22 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3193  hypothetical protein  27.22 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198196  normal  0.951691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3389  protein of unknown function DUF88  27.81 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0796  protein of unknown function DUF88  38.14 
 
 		 165 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2746  protein of unknown function DUF88  37.11 
 
 		 165 aa  64.7  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0482662  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1835  hypothetical protein  29.52 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0035  protein of unknown function DUF88  36.36 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153842  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0671  hypothetical protein  30.36 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0944  hypothetical protein  29.27 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0294476  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0033  hypothetical protein  35.35 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_004310  BR0649  hypothetical protein  36.26 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1654  protein of unknown function DUF88  26.94 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0466931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3836  hypothetical protein  36.96 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4688  protein of unknown function DUF88  26.06 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.706781  normal  0.898673 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0379  protein of unknown function DUF88  28.66 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.31368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0945  hypothetical protein  29.3 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.279417 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2638  hypothetical protein  35.16 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2645  hypothetical protein  27.61 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  hitchhiker  0.00814137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2606  hypothetical protein  27.61 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0253982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4322  hypothetical protein  28.48 
 
 		 173 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.31115  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2633  hypothetical protein  27.61 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0521932  normal  0.18275 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2257  hypothetical protein  27.61 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4689  hypothetical protein  27.61 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.501693  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1924  hypothetical protein  27.61 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0224  protein of unknown function DUF88  36.26 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.121246  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4322  hypothetical protein  27.61 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.833366  normal  0.664553 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0528  hypothetical protein  33.7 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0275005  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2110  hypothetical protein  28.22 
 
 		 173 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850864  normal  0.350459 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5380  protein of unknown function DUF88  36.63 
 
 		 356 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.458157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2966  protein of unknown function DUF88  32.97 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180481  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0489  protein of unknown function DUF88  26.92 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3645  protein of unknown function DUF88  26.09 
 
 		 180 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00589  hypothetical protein  35.71 
 
 		 156 aa  57  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1873  protein of unknown function DUF88  26.09 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.769697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1847  protein of unknown function DUF88  26.09 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1710  hypothetical protein  30.36 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0433  protein of unknown function DUF88  26.21 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0758  hypothetical protein  30.54 
 
 		 158 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3176  hypothetical protein  28.05 
 
 		 157 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3175  hypothetical protein  33.66 
 
 		 157 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3319  hypothetical protein  33.66 
 
 		 157 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.821326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1195  protein of unknown function DUF88  33.66 
 
 		 157 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2805  hypothetical protein  30.69 
 
 		 189 aa  53.1  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2790  hypothetical protein  33.66 
 
 		 157 aa  53.5  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1723  hypothetical protein  32.61 
 
 		 207 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.761661  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4909  hypothetical protein  34.38 
 
 		 279 aa  52.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0665884  normal  0.351144 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1148  hypothetical protein  34.23 
 
 		 157 aa  52.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.882158  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3490  hypothetical protein  33.66 
 
 		 157 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3730  hypothetical protein  29.25 
 
 		 159 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4782  hypothetical protein  26.83 
 
 		 159 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0652  hypothetical protein  26.22 
 
 		 159 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00256756  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4769  hypothetical protein  26.22 
 
 		 159 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40399  hitchhiker  0.00938493 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0372  hypothetical protein  27.95 
 
 		 184 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000170684  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4644  hypothetical protein  26.22 
 
 		 159 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.54947  normal  0.0402437 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0893  hypothetical protein  32.67 
 
 		 158 aa  50.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1288  hypothetical protein  35.19 
 
 		 157 aa  50.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000264072  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1877  hypothetical protein  28.07 
 
 		 194 aa  49.7  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000471771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1578  hypothetical protein  34.41 
 
 		 179 aa  49.3  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0544432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3118  hypothetical protein  33.66 
 
 		 157 aa  49.7  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.26612 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1143  hypothetical protein  26.58 
 
 		 198 aa  49.3  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1080  hypothetical protein  33.66 
 
 		 184 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1943  hypothetical protein  27.16 
 
 		 236 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.423508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2722  hypothetical protein  26.88 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353362  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12750  hypothetical protein  29.92 
 
 		 167 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.019537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4859  hypothetical protein  26.88 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0181079  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1173  hypothetical protein  33.03 
 
 		 157 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.751958 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0134  hypothetical protein  26.71 
 
 		 157 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1080  hypothetical protein  32.43 
 
 		 170 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0515  transcriptional regulator, LacI family  31.85 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1407  hypothetical protein  31.68 
 
 		 157 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1154  hypothetical protein  25.61 
 
 		 157 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.215618  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1362  hypothetical protein  31.76 
 
 		 157 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0533358  hitchhiker  0.000590839 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4925  hypothetical protein  29.41 
 
 		 159 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1025  hypothetical protein  31.68 
 
 		 260 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0102117  normal  0.260028 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0482  hypothetical protein  25.32 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2303  protein of unknown function DUF88  28.85 
 
 		 168 aa  47  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2008  protein of unknown function DUF88  24.83 
 
 		 304 aa  46.6  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0888225  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2466  hypothetical protein  30.93 
 
 		 228 aa  46.6  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>