More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3717 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3717  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 217 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4194  lysine exporter protein LysE/YggA  97.24 
 
 		 215 aa  362  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288447  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1714  lysine exporter protein LysE/YggA  87.56 
 
 		 238 aa  360  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4067  lysine exporter protein LysE/YggA  91.28 
 
 		 218 aa  352  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4299  lysine exporter protein LysE/YggA  91.28 
 
 		 218 aa  352  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3218  lysine exporter protein LysE/YggA  91.28 
 
 		 217 aa  348  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4307  lysine exporter protein LysE/YggA  86.18 
 
 		 268 aa  315  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.85 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  38.79 
 
 		 208 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.98 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  36.92 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.38 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  35.35 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  28.77 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.3 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  34.86 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  35.68 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.46 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  36.59 
 
 		 212 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.05 
 
 		 206 aa  101  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.05 
 
 		 206 aa  101  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2130  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.25 
 
 		 205 aa  101  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  30.05 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  30.05 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.05 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.05 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.05 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  30.05 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.05 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.27 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.02 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  32.39 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.91 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  37.02 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  31.88 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  33.81 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.66 
 
 		 207 aa  99  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.87 
 
 		 211 aa  98.2  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3633  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.72 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  35.12 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  28.64 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6543  lysine exporter protein LysE/YggA  40.59 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.72 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  35.61 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  35.92 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  35.92 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  34.45 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  37.14 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  30.92 
 
 		 211 aa  95.5  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.93 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.93 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  27.23 
 
 		 204 aa  95.1  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.93 
 
 		 206 aa  95.1  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  36.15 
 
 		 211 aa  95.1  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  35.55 
 
 		 222 aa  94.7  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  33.8 
 
 		 211 aa  94.7  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  35.55 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  35.55 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.48 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.41 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  34.29 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  36.23 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.68 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.96 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4240  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.52 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  29.72 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4287  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.52 
 
 		 206 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.414866 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  32.86 
 
 		 209 aa  92.4  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4347  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.52 
 
 		 206 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1265  lysine exporter protein LysE/YggA  37.14 
 
 		 208 aa  92.4  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  32.37 
 
 		 217 aa  92  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  27.49 
 
 		 210 aa  92  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  38.1 
 
 		 203 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  32.69 
 
 		 217 aa  91.3  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4189  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.52 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4168  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.52 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.77 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3922  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.93 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.325521  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2358  putative lysine exporter protein  37.74 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  28.97 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  34.16 
 
 		 208 aa  89.7  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.85 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  31.1 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  28.97 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0140  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.69 
 
 		 210 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  34.29 
 
 		 208 aa  88.2  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  29.67 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.51 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  36.31 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 		 207 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.91 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.75 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  31.02 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2802  lysine exporter protein LysE/YggA  32.21 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>