More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2631 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2502  benzoylformate decarboxylase  98.13 
 
 		 535 aa  1032    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.745207 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6157  benzoylformate decarboxylase  75.28 
 
 		 537 aa  785    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830904  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0346  benzoylformate decarboxylase  79.53 
 
 		 539 aa  768    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1048  benzoylformate decarboxylase  79.53 
 
 		 539 aa  766    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5914  benzoylformate decarboxylase  93.08 
 
 		 535 aa  928    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0093  benzoylformate decarboxylase  79.53 
 
 		 539 aa  768    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0705  benzoylformate decarboxylase  80.99 
 
 		 539 aa  822    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214381  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1545  benzoylformate decarboxylase  69.41 
 
 		 548 aa  709    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.936505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0887  benzoylformate decarboxylase  79.53 
 
 		 539 aa  766    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152058  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  88.81 
 
 		 536 aa  928    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0890  benzoylformate decarboxylase  79.53 
 
 		 539 aa  766    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2631  benzoylformate decarboxylase  100 
 
 		 535 aa  1054    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2480  benzoylformate decarboxylase  79.53 
 
 		 539 aa  768    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.20481  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  94.21 
 
 		 535 aa  984    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  94.39 
 
 		 535 aa  985    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0645  benzoylformate decarboxylase  79.53 
 
 		 539 aa  768    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0521172  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1999  benzoylformate decarboxylase  73.11 
 
 		 529 aa  745    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  70.91 
 
 		 529 aa  751    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  57.28 
 
 		 518 aa  575  1.0000000000000001e-163  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5047  benzoylformate decarboxylase  56.41 
 
 		 533 aa  560  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  51.74 
 
 		 551 aa  523  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1799  benzoylformate decarboxylase  52.43 
 
 		 542 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  52 
 
 		 540 aa  501  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3938  benzoylformate decarboxylase  51.14 
 
 		 540 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  51.89 
 
 		 540 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  47.51 
 
 		 499 aa  438  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  46.62 
 
 		 540 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  46.78 
 
 		 536 aa  425  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  46.86 
 
 		 549 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  47.47 
 
 		 528 aa  421  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  47.51 
 
 		 527 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1088  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.94 
 
 		 533 aa  409  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.703546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  46.48 
 
 		 528 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  43.73 
 
 		 529 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0137  benzoylformate decarboxylase  45.56 
 
 		 525 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1542  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  47.32 
 
 		 542 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  46.26 
 
 		 528 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2776  benzoylformate decarboxylase  38.03 
 
 		 535 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  39.02 
 
 		 540 aa  299  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  33.94 
 
 		 554 aa  279  9e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2750  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.51 
 
 		 562 aa  251  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2455  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.01 
 
 		 562 aa  250  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521664  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2527  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.51 
 
 		 562 aa  249  7e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2501  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.76 
 
 		 658 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  34.16 
 
 		 545 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1761  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.44 
 
 		 559 aa  219  7.999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15439  hitchhiker  0.00802646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.29 
 
 		 568 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.19 
 
 		 542 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0092  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.4 
 
 		 561 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.554485  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  27.42 
 
 		 589 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1973  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  31.74 
 
 		 572 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2432  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.7 
 
 		 503 aa  187  4e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.157396  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0534  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.77 
 
 		 565 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1115  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.51 
 
 		 566 aa  181  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  28.18 
 
 		 551 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  29.33 
 
 		 562 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.62 
 
 		 563 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  27.36 
 
 		 552 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.75 
 
 		 552 aa  169  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  26.95 
 
 		 567 aa  169  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.16 
 
 		 573 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.74 
 
 		 596 aa  167  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1108  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.04 
 
 		 489 aa  166  8e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0811747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.7 
 
 		 554 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.43 
 
 		 558 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.26 
 
 		 557 aa  164  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00079  acetolactate synthase III large subunit  28.39 
 
 		 574 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00078  hypothetical protein  28.39 
 
 		 574 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0125  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.16 
 
 		 584 aa  163  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.14 
 
 		 553 aa  163  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3522  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.39 
 
 		 574 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0624  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.21 
 
 		 574 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.146468 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3580  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.39 
 
 		 574 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0079  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.39 
 
 		 574 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0086  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.39 
 
 		 574 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0634  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.98 
 
 		 573 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.04 
 
 		 604 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.16 
 
 		 584 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.14 
 
 		 587 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0127  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.16 
 
 		 584 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.53134  hitchhiker  0.000772873 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.33 
 
 		 593 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3605  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.06 
 
 		 572 aa  162  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0128  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.16 
 
 		 584 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.16 
 
 		 584 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.084297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.21 
 
 		 574 aa  161  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.630637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1934  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.66 
 
 		 571 aa  159  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  27.37 
 
 		 566 aa  159  9e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.88 
 
 		 569 aa  159  9e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.85 
 
 		 556 aa  159  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0736  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.82 
 
 		 597 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.591869  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.45 
 
 		 570 aa  159  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.42 
 
 		 564 aa  159  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.48 
 
 		 558 aa  158  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.49 
 
 		 582 aa  157  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2267  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.61 
 
 		 549 aa  157  4e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.158148 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00556  acetolactate synthase III large subunit  26.92 
 
 		 572 aa  157  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.88 
 
 		 572 aa  157  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.33 
 
 		 571 aa  156  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.76 
 
 		 575 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.76 
 
 		 575 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>