150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2618 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5902  hypothetical protein  83.64 
 
 		 431 aa  677    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.834599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1959  hypothetical protein  83.86 
 
 		 433 aa  700    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.479808  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2618  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  873    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2570  hypothetical protein  84.09 
 
 		 433 aa  703    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0726  hypothetical protein  79.28 
 
 		 435 aa  638    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.299364 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2594  hypothetical protein  83.64 
 
 		 433 aa  687    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2489  hypothetical protein  96.82 
 
 		 440 aa  790    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.457254  normal  0.59095 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0715  hypothetical protein  76.67 
 
 		 505 aa  522  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0023847  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0357  hypothetical protein  79.29 
 
 		 522 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000555141  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1059  hypothetical protein  79.59 
 
 		 519 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.51988  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0657  hypothetical protein  79.29 
 
 		 522 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2492  hypothetical protein  79.29 
 
 		 522 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000876051  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0899  hypothetical protein  79.88 
 
 		 525 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103522  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0902  hypothetical protein  79.59 
 
 		 525 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0290977  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0105  hypothetical protein  79.29 
 
 		 522 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0559982  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0512  hypothetical protein  69.88 
 
 		 379 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.204603  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3223  protein of unknown function DUF72  56.48 
 
 		 489 aa  458  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.873397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0739  hypothetical protein  61.05 
 
 		 422 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0785  protein of unknown function DUF72  52.42 
 
 		 361 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.223922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0715  protein of unknown function DUF72  53.01 
 
 		 361 aa  336  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  0.0915207 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0813  hypothetical protein  50.72 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0765  hypothetical protein  54.37 
 
 		 355 aa  327  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.143157 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2789  protein of unknown function DUF72  50.62 
 
 		 359 aa  306  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0971015  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2644  hypothetical protein  50 
 
 		 356 aa  302  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1823  hypothetical protein  52.15 
 
 		 382 aa  299  8e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.599232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1999  protein of unknown function DUF72  46.41 
 
 		 363 aa  273  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.108887  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1704  hypothetical protein  47.01 
 
 		 365 aa  272  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.792663 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1869  hypothetical protein  48.03 
 
 		 390 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3371  hypothetical protein  43.48 
 
 		 374 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241512  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0200  protein of unknown function DUF72  44.58 
 
 		 339 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1934  protein of unknown function DUF72  30.09 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.978403  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  28.64 
 
 		 273 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3869  hypothetical protein  25.38 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0151783 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  27.57 
 
 		 279 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  24.88 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  25.37 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  31.47 
 
 		 254 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  24.88 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  27 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  30.96 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  26.2 
 
 		 313 aa  67  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  26.51 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  24.5 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  27.57 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  23.5 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  26.46 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  27.87 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  22.5 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  27 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  26.46 
 
 		 269 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  26.73 
 
 		 264 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  26.11 
 
 		 268 aa  62  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  25 
 
 		 267 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  25.73 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  27.23 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  25.47 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  23.21 
 
 		 241 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  26.4 
 
 		 272 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  24.42 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  28.77 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  27.98 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  25.81 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  25.98 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  22.66 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  24.87 
 
 		 264 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  24.41 
 
 		 242 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  28.18 
 
 		 265 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  27.94 
 
 		 303 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  28.08 
 
 		 249 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  25.35 
 
 		 251 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1411  hypothetical protein  30.72 
 
 		 245 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  25 
 
 		 267 aa  54.3  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  28.65 
 
 		 254 aa  53.9  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  25.6 
 
 		 249 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  25 
 
 		 321 aa  53.5  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  30.53 
 
 		 289 aa  53.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  24.88 
 
 		 243 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  27.98 
 
 		 249 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  24.88 
 
 		 308 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0353  hypothetical protein  30.3 
 
 		 259 aa  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0504287 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  27.13 
 
 		 248 aa  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  26.13 
 
 		 303 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  28.44 
 
 		 241 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2381  hypothetical protein  34.34 
 
 		 243 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190357 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  28.79 
 
 		 293 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  27.46 
 
 		 249 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  28.27 
 
 		 271 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  25.58 
 
 		 277 aa  51.2  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2157  hypothetical protein  27.47 
 
 		 265 aa  51.2  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  25.24 
 
 		 305 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  24.23 
 
 		 282 aa  51.2  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  26.73 
 
 		 308 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  27.21 
 
 		 244 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0893  hypothetical protein  26.4 
 
 		 316 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  31.02 
 
 		 282 aa  50.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  26.19 
 
 		 242 aa  50.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  26.18 
 
 		 248 aa  50.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  25 
 
 		 242 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  27.08 
 
 		 244 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  28.35 
 
 		 284 aa  50.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>