More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6608 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 189 aa  386  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  62.5 
 
 		 214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  56.98 
 
 		 189 aa  193  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  51.38 
 
 		 184 aa  185  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  55.11 
 
 		 194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2170  DNA invertase  60.8 
 
 		 281 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0593579  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6782  resolvase domain-containing protein  59.78 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.504828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  55.13 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1218  putative invertase  61.14 
 
 		 183 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6785  resolvase domain-containing protein  59.66 
 
 		 195 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  53.41 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  52.27 
 
 		 184 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6610  resolvase domain-containing protein  57.39 
 
 		 192 aa  170  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.874577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  52.27 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  55.7 
 
 		 203 aa  168  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  50.54 
 
 		 188 aa  169  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  53.41 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  53.41 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  51.14 
 
 		 189 aa  167  8e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  51.7 
 
 		 188 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  51.72 
 
 		 188 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  51.7 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  51.72 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  51.7 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  50.29 
 
 		 193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  49.73 
 
 		 190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  51.14 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  51.14 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  51.14 
 
 		 188 aa  161  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  54.43 
 
 		 188 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  51.41 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  50.57 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  45.51 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  47.78 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  49.17 
 
 		 191 aa  159  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  49.71 
 
 		 193 aa  157  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  48.68 
 
 		 307 aa  157  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  48.68 
 
 		 307 aa  157  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  48.31 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  48.31 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  44.74 
 
 		 201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  51.69 
 
 		 194 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  52.26 
 
 		 201 aa  154  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  58.04 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  46.99 
 
 		 192 aa  151  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  43.3 
 
 		 193 aa  151  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  49.73 
 
 		 189 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  48.62 
 
 		 186 aa  148  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  51.28 
 
 		 196 aa  147  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  44.51 
 
 		 203 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  51.32 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  47.51 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  46.41 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  45.6 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  52.78 
 
 		 309 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0585  resolvase-like protein  52.2 
 
 		 189 aa  145  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.698292  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  53.85 
 
 		 197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  53.85 
 
 		 197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  51.77 
 
 		 183 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  50 
 
 		 219 aa  142  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  51.77 
 
 		 183 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  44.2 
 
 		 196 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  49.12 
 
 		 218 aa  141  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  48.88 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  52.5 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  46.67 
 
 		 197 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  46.67 
 
 		 197 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  46.67 
 
 		 197 aa  138  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  42.94 
 
 		 188 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  45.3 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  41.21 
 
 		 181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  51.75 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  46.75 
 
 		 305 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  41.67 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  47.78 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  46.5 
 
 		 213 aa  134  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  48.67 
 
 		 309 aa  134  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  44.39 
 
 		 191 aa  134  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  49.07 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  50 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  45.36 
 
 		 206 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4796  resolvase domain-containing protein  48.2 
 
 		 310 aa  132  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  48.92 
 
 		 313 aa  132  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  47.44 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  50.84 
 
 		 189 aa  131  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  50.38 
 
 		 201 aa  131  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  45.98 
 
 		 192 aa  130  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  43.01 
 
 		 193 aa  130  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  52.6 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  43.01 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  43.02 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  51.12 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  41.58 
 
 		 293 aa  129  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4189  TonB-dependent receptor protein  42.63 
 
 		 294 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3914  resolvase domain-containing protein  50.71 
 
 		 293 aa  128  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  41.58 
 
 		 326 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  44.37 
 
 		 189 aa  128  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  41.4 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  51.45 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>